十八届三中全会提出健全技术创新市场导向机制。作为技术创新重要组成部分的研发投入如何从政府导向转移到市场导向是健全技术创新市场导向机制的关键。研发投入的绩效取决于研发投入的运行机制及相关的制度安排。政府主导的研发投入机制可以搞出发明，但无法搞出创新，而市场导向机制的独特之处在于创新而非发明。自主创新中研发投入的市场导向比政府导向更有效率。从面对不确定性和风险承担来看，市场主导的研发机制比政府主导的研发机制更有利于减少不确定性和分散风险。深化我国科技体制改革，研发投入必须从政府为主转向市场为主。要打破研发投入上的行政主导和部门分割，建立主要由市场决定技术创新项目和经费分配、评价成果的机制。遵循研发投入的规律，形成政府与市场的合理分工。建立有利于研发投入绩效提高的配套环境，教育和培训体系非常重要。