【摘 要】
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目的:基于化学结构特点研究植物Dregea sinensis中多氧孕烷糖苷的生物活性,以及化合物分子与靶蛋白分子间的作用机理。方法:本研究采用分子对接和表面等离子体共振方法,对191个多氧化孕烷糖苷类成分(>800 Da)进行了免疫活性及其与免疫蛋白的动力学评价。结果:通过分子对接方法筛选出7个配体分子(6、18、23、30、78、79和80)和3个免疫相关蛋白(IL-2Rα、TLR4和TNF-α
【机 构】
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北京理工大学生命学院生物医药成分分离与分析北京市重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(81503353); 国家科技部仪器专项资助项目(2012YQ040140);
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目的:基于化学结构特点研究植物Dregea sinensis中多氧孕烷糖苷的生物活性,以及化合物分子与靶蛋白分子间的作用机理。方法:本研究采用分子对接和表面等离子体共振方法,对191个多氧化孕烷糖苷类成分(>800 Da)进行了免疫活性及其与免疫蛋白的动力学评价。结果:通过分子对接方法筛选出7个配体分子(6、18、23、30、78、79和80)和3个免疫相关蛋白(IL-2Rα、TLR4和TNF-α)。研究表明化合物30和78在SPR实验中与靶蛋白IL-2Rα和TLR4具有显著的结合趋势,与IL-2Rα的结合常数KD分别为2.41×10-6和2.14×10-6 mol/L,与TLR4则分别为1.96×10-5和5.60×10-6 mol/L。分子动力学研究进一步表征SPR阳性分子6、18、30、78和80与靶蛋白之间的相互作用基团。结论:研究揭示多氧化孕烷糖苷类成分可以通过形成氢键和Pi-Pi相互作用与靶蛋白结合。研究内容对快速评价多氧化孕烷糖苷类成分的活性具有重要意义,为揭示低丰度药效物质的潜在作用机制进行了有益探索。
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