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随着治理污水力度不断加大，日本濑户内海2011年每升海水中氮元素的含量下降到0.14毫克，不到1983年时0.34毫克的一半。海水透明度得到大幅提升，连靠近日本三大工业地带之一阪神工业地带的大阪湾，海水透明度也从3米增加到了6米。水中的氮、磷等浮游植物生长所需营养物质大幅度减少，不少人怀疑，这是导致以浮游植物为食的鱼类和贝类减少的主因。