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探讨聚合酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)-荧光探针法在检测丙型肝炎病毒(HCV)基因型中的应用价值。
方法随机选择2016年3月至6月来自全国各地的166例慢性HCV感染者血清样本,采用逆转录巢式PCR扩增HCV的Core-E1(CE1)基因区域和测序、系统发育树分析确定基因亚型,并采用PCR-荧光探针法对HCV基因型进行检测。采用Kappa检验对两种方法测得的HCV分型结果进行比较。
结果巢式PCR测序法共分型166例,其中1b型66例(39.8%),2a型34例(20.5%),3a型16例(9.6%),3b型为27例(16.2%),6a型23例(13.9%);PCR-荧光探针法共分型166例,其中1b型68例(41.0%),2a型34例(20.5%),3a型16例(9.6%),3b型25例(15.0%),6a型23例(13.9%)。PCR-荧光探针法分型中的2例1b型,测序法分型为3b型,两种方法检测一致率为98.7% (164/166),差异无统计学意义(χ2=0.0492,P>0.05)。
结论PCR-荧光探针法对我国常见的HCV基因型鉴定准确率高,在临床上值得推广应用。