【摘 要】
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为探究9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)基因家族进化特性,本文利用生物信息学方法,对菊分支类群已完成测序的植物(包括番茄、马铃薯、烟草、甜菜、猴面花)基于全基因组进行N
【机 构】
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浙江省农业科学院蔬菜研究所,南京农业大学,上海华维节水灌溉有限公司
【基金项目】
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浙江省自然科学基金(LQ12C15004), 国家自然科学基金资助项目(31071800), 浙江省农业新品种选育重大科技专项(2012C12903), 农业部公益性行业(农业)科研专项经费(201403032,201003065), 国家科技支撑计划(2012BAD02B02), 农业部产业化项目(CARS-25-G-16)
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为探究9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)基因家族进化特性,本文利用生物信息学方法,对菊分支类群已完成测序的植物(包括番茄、马铃薯、烟草、甜菜、猴面花)基于全基因组进行NCED基因家族鉴定,并对其蛋白序列特征,保守基序,次级结构以及系统发育关系进行分析。结果表明,NCED酶是由小基因家族编码的酶,其成员为2~4个。蛋白质氨基酸大小在505~652aa之间,分子质量为56.23~71.42 k Da,除Sl NCED6外,其余各蛋白的等电点均表现为酸性,保守基序分析发现各成员均包含10个保守基序,其
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