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本文综述了湖泊生态系统中的生物多样性问题。导致湖泊生态系统中的生物多样性下降的主要原因有:(1)河流冲刷淤积和围湖造田造成的湖泊生态系统的萎缩、碎裂;(2)江湖阻隔对江湖复合生态系统的破坏;(3)过度捕杀导致鱼类种类多样性的下降及优势鱼类的小型化;(4)水草顶级群落消失带来的次生性灭绝;(5)城郊湖泊加速富营养化造成的生境污染。