原子-键电负性均衡方法相关论文
本论文的工作主要分为两大部分:一、通过对ABEEMσπ力场模型中计算静电相互作用项串行程序中多个循环相互嵌套部分的分析,提出带状......
理解化学反应性是理论化学所追求的一个主要目标.ABEEM是在Mortier等提出的电负性均衡方法(EEM)和Yang等提出的修正电负性均衡方法......
学位
动力学模拟方法已经成为探索生物体系规律和本质的一种重要的工具,其模拟的结果很大程度上取决于所采用的分子力场的优劣。目前广泛......
蛋白质是生命体的重要组成部分,其中1/3的蛋白质中含有金属。这些金属离子作为金属蛋白中最重要的辅因子,承担着活性中心或结构中心......
本文截取不同长度的蛋白质多肽残基,并使用HF/STO-3G计算了体系的Mulliken电荷分布。使用ABEEMσπ参数,计算获得了不同长度的蛋白......
原子-键电负性均衡方法(ABEEM)是以密度泛函理论(DFT)和电负性均衡原理为基础发展而来,它明确地考虑了化学键是不引入任何实验数......
期刊
应用ABEEM/MM模型计算了中等大小水分子团簇(H2O)n(n=7~10)的各种性质,如:优化的几何构型、氢键个数、结合能、稳定性、ABEEM电荷分......
应用原子-键电负性均衡方法,计算了含镍超氧化物歧化酶活性中心原子的电荷分布和Fukui函数.结果表明,超氧化物歧化酶活性中心与超氧阴......
应用原子-键电负性均衡方法计算了超氧化物歧化酶的电荷分布和Fukui函数.结果表明,超氧化物歧化酶活性中心与超氧阴离子自由基作用时......
应用ABEEM/MM模型计算了较大的水分子团簇(H2O)n(n=11~16)的各种性质,如:优化的几何构型,氢键个数,结合能,稳定性,ABEEM电荷分布,偶极矩,......
应用原子-键电负性均衡方法,计算了血红素与小分子的配位络合物的电荷分布和Fukui函数.血红素与氧、水、一氧化碳和一氧化氮结合时,铁......
应用ABEEM/MM模型研究和计算了水分子团簇(H2O)n (n=7—35)的各种性质,如:优化的几何构型,氢键个数,结合能,稳定性,ABEEM电荷分布,偶极矩,以及结......
应用密度泛函理论计算并研究了HIV-lPR活化位点的硬度、软度、化学势和电负性,分析了酶-水络合物、酶-抑制剂络合物及酶-抑制剂-水......
原子-键电负性均衡方法(ABEEM)是以密度泛函理论(DFT)和电负性均衡原理为基础发展而来,它明确地考虑了化学键是不引入任何实验数据......
建立应用于多肽和蛋白质模拟的ABEEM/MM浮动电荷力场. 利用该模型和参数, 对实际蛋白质分子Crambin(植物种子中的一种小的蛋白质)......
利用原子-键电负性均衡方法计算了700多个异构体的硬度,通过与标准生成焓所确定的相对稳定性比较后发现,多数异构体并不遵守最大硬度......
利用Matlab软件编写程序, 将基于密度泛函理论和电负性均衡原理发展的原子-键电负性均衡方法σ-π模型(ABEEM σ-π)计算的电荷分布,......
采用B3LYP/6-311++G(d ,p)方法,优化了4个锌指蛋白分子和31个模型分子的几何构型,使用H F/S T O-3G计算了优化后体系的M ulliken电荷分布.......
应用量子化学方法和原子-键电负性均衡方法(ABEEM)对Na+(H2O)n和K+(H2O)n(n=1~6)体系进行研究.采用MP2/6-31++G(d,p)方法进行几何构型的优化及频率......
采用原子-键电负性均衡方法,计算蚯蚓血红蛋白活性中心原子的电荷分布及Fukui函数.在脱氧蚯蚓血红蛋白活性中心的两个铁离子中,即......
锌指蛋白在基因的表达调控、细胞分化以及胚胎发育等过程中发挥重要的作用。本文主要针对以组氨酸和半胱氨酸两种氨基酸为配体的四......
超支化聚合物是一类具有准球形结构的高度支化大分子,在其不规则的分子结构中含有大量内部空穴和末端官能团。由于超支化聚合物独......
在药物设计中,以酶作为药物的靶点历史悠久,至今仍是重要的研究对象。临床应用的许多药物是通过特异性地抑制或者少数是激活酶活性......
在密度泛函理论和电负性均衡方法基础上建立的原子-键电负性均衡方法中的s p 模型,明确地考虑了双键中的π键部分,在计算和解释有......
学位
在密度泛函理论和电负性均衡方法基础上建立的原子-键电负性均衡方法中的σπ模型明确地考虑了双键中的π键部分,在计算和解释大分......
学位
发展准确、快速的计算方法来探讨大分子体系的结构和性质间的内在关系是当今理论化学界的热点课题之一。密度泛函理论下的电负性均......
解离常数pKa是用来描述物质在水溶液中得失质子程度的物理量。通过离子残基的pKa值能够了解蛋白质的pH依赖性的特点和一些酶的催化......