结合自由能相关论文
本研究采用分子动力学模拟方法探究了互为同分异构体的2种植物雌激素芹菜素和染料木素与雌激素受体ERα及ERβ之间的结合亲和力，选......
神经退行性疾病是大脑和脊髓的细胞神经元缺失而引起的不可逆转的疾病,病因尚不明确,也无彻底治愈的特效药。近年来病患数量在不断......
艾滋病,又称获得性免疫缺陷综合症（Acquired Immunodeficiency Syndrome,AIDS）,是一种危害性极大的全球性疾病。其主要致病病原体为1......
分子动力学模拟可以用来研究生物大分子体系的各种性质,如：预测受体和配体之间的亲和力,模拟蛋白质的折叠过程,研究蛋白质与细胞膜......
本论文主要采用计算生物学方法对蛋白-蛋白、蛋白-小分子等相互作用体系进行深入研究,阐明其相互作用机理。论文包括两个课题的研......
线粒体丝氨酸羟甲基转移酶（SHMT2）在细胞内通过催化丝氨酸与甘氨酸的转化参与细胞增殖的重要原料—一碳单位（1C）的循环。研究发现SHMT2......
2019年12月由新型肺炎冠状病毒（SARS-Co V-2）感染导致的肺炎（COVID-19）疫情大规模爆发,并于2020年3月被世界卫生组织宣布为全球大流行.......
近一个世纪以来,胰岛素已经被证明是治疗糖尿病的一种关键药物。在生理条件下,血糖的调节是一个很复杂的过程,它涉及到胰岛素六聚......
癌症对人类的生活和健康有着巨大的不利影响。抗肿瘤疗法自其发明以来已经发生了巨大的变化,尤其是近年来免疫治疗一直是肿瘤治疗......
氧化还原酶主要催化生物体的氧化和还原反应,生物体的生长、代谢、繁殖等生命活动都与氧化还原反应具有非常密切的关联。对生命活......
目前,严重威胁人类健康的重大疾病包括糖尿病、癌症等等。据国际糖尿病联盟（International Diabetes Federation,IDF）在2020年发布的......
目的 分析adc-57型头孢菌素酶分子进化及其对各种底物的结合自由能.方法 用mega 5.0软件中的最小进化法分析adc-57和其他19种β-内......
高脂血症是动脉粥样硬化性心血管疾病的一个重要危险因素，高脂血症促进动脉粥样硬化的发生发展，增加斑块的不稳定性，动脉粥样硬化斑块......
布鲁顿式酪氨酸激酶(Bruton’s tyrosine kinase)是近来治疗B细胞恶性肿瘤的明星靶点,在很多疾病和信号通路中起着关键作用,现已成......
在古细菌中发现的极端嗜热蛋白是一类高度保守的核酸结合蛋白,它在核染色质组织以及基因调节过程中有着重要的作用。极端嗜热蛋白......
蛇形蛋白SMO是Hedgehog信号通路的重要组分。GDC-0449是第一个上市的SMO靶向药,目前用于治疗晚期基底细胞癌。然而,SMO的D473H突变......
RCOK已成为新药研发的重要靶标之一,包括ROCK1和ROCK2两个亚型蛋白。虽然它们高度同源性,但大量研究表明ROCK1和ROCK2有着显著的不......
α-L-鼠李糖苷酶因其可以水解一些天然糖苷类物质如柚皮苷、芦丁等末端的鼠李糖基,在食品和生物医药工业有着广泛的应用。α-L-鼠......
细胞色素P450(Cytochrome P450,P450)酶是一类以铁卟啉环作为辅基的单氧酶。目前为止,该酶在自然界中主要有两个生理功能,一是内源......
转录因子是一种具有序列特异性的DNA结合蛋白。随着蛋白质晶体解析技术的飞速发展,已经积累了大量的转录因子核酸复合物晶体结构,......
纳米科技迅速发展,新型纳米材料的研究越来越具有战略意义。纳米材料在生物医学领域展现出蓬勃的活力,其生物安全性有待进一步的研......
α7型乙酰胆碱受体（α7-nAChR）作为攻克帕金森、重症肌无力、神经性疼痛等疾病的靶点，已经受到越来越多的重视。目前关于其激动剂的研......
蛋白质-配体的结合过程伴随着复杂的结构变化,在分子模拟可及的时间尺度内难以完全捕获,这使得准确估计蛋白质-配体的结合自由能十......
乙型肝炎核心病毒样颗粒HBc-VLPs(Hepatitis B Core Antigen Virus-like Particles)因稳定性好且易于改造,被作为疫苗载体广泛使用......
随着现代免疫学的发展,细胞毒性T淋巴细胞(Cytotoxic T lymphocyte, CTL)在肿瘤、感染与自身免疫性疾病中发挥的重要作用越来越受......
以CTL (cytotoxic T cell)表位为基础制备表位疫苗,是目前对恶性肿瘤等影响人类健康的重要疾病进行免疫治疗的重要方法之一。在细......
嗅觉系统能够感知外界环境中瞬息万变的气味信号，对于生命体的觅食、求偶、避险、繁殖和警戒等各种生命活动都有重要意义。在气味的......
TCR识别MHC提呈的抗原肽具有高灵敏性和特异性，识别过程中存在结构和能量的变化。精确计算大分子体系的自由能面临非常多的困难。一......
在药物设计中,以酶作为药物的靶点历史悠久,至今仍是重要的研究对象。临床应用的许多药物是通过特异性地抑制或者少数是激活酶活性......
基因药物的出现可以使人们征服一切疾病,因此,基因药物一直是科研工作者研究的热点领域。多胺类药物小分子良好的生物活性使其成为......
乙酰胆碱酯酶是一种广泛存在于动物昆虫体内的水解酶，它将神经递质乙酰胆碱水解为胆碱和乙酸，其主要存在于神经肌肉接头与胆碱能神经......
目的 分析KPC-12型碳青霉烯酶分子进化及其与10种β-内酰胺类药物的结合自由能.方法 根据有无碳青霉烯酶活性将A类β-内酰胺酶分为......
为探究吕家坨井田地质构造格局,根据钻孔勘探资料,采用分形理论和趋势面分析方法,研究了井田7......
采用分子动力学模拟和结合自由能计算研究了抑制剂APV与HIV-1蛋白酶的作用机制.研究结果表明范德瓦尔斯作用主控了APV与HIV-1蛋白......
主要通过分子对接(autodock)、分子动力学(MD)模拟和结合自由能(MM/PBSA)计算等方法研究了3种酮类曼尼希碱衍生物抑制剂(下文它们......
目的 分析KPC-2、KPC-5和KPC-10型碳青霉烯酶的分子进化及与10种β-内酰胺类药物的结合自由能.方法 用MEGA 4.1软件中的Minimum Ev......
以蛋白质晶体结构数据库PDB中FX-fexaramine复合物(PDB代码:1OSH)三维结构为研究对象,采用Ligandfit作为采样工具,筛选到中草药中1......
p53-MDM2相互作用的抑制已经成为治疗癌症的新方法.本文将分子动力学模拟和MM-PBSA(molecular mechanics/passion-Boltzman surfac......
为分析和解释2个小分子抑制剂ADS—J1和ADS—J2与艾滋病病毒蛋白gp41的抑制机理，通过采用理论计算的方式把抑制剂和gp41蛋白疏水性......
对雌激素受体ERa和ER8与抑制剂244结合的体系进行了12ns的分子动力学模拟，用MM-PBSA方法计算了体系的结合自由能，抑制剂与ERa的结合......
通过分析蛋白质-蛋白质间的静电、疏水作用和熵效应与相对于晶体结构的蛋白质主链原子的均方根偏差(RMSD)的相关性,定量地考查了它......
本研究采用分子动力学模拟方法探究了4种木脂素类植物雌激素与雌激素受体ER_α及ER_β之间的结合亲和力。结果表明:四种木脂素类植......
采用LigandFit作为构象采样工具,以230个蛋白质-配体复合物组成的预测集,系统地比较了14种自由能评价函数(Ligscore1、Ligscore2、......
【目的】研究小菜蛾性信息素与性信息素结合蛋白、受体蛋白之间作用的关键氨基酸残基和作用力类型,揭示小菜蛾识别性信息素的分子......
用自由能微扰方法(FEP)计算了两种hydroxamate类的抑制剂和MMP-3的相对结合自由能.在计算中,对于催化区的锌离子与其共价结合的配......
