基因预测相关论文
基因预测是基因组分析的重要内容之一,是理解基因调控与表达的关键环节。基因预测的准确度将直接影响后续的基因功能注释等任务的......
翻译起始位点(TIS,即基因5′端)的精确定位是原核生物基因预测的一个关键问题,而基因组GC含量和翻译起始机制的多样性是影响当前TIS......
在表层土壤、森林分解中的枯枝落叶、秸秆还田后的土壤等样品中,蕴含着大量的细菌、真菌、原生动物等微生物,其中真菌发挥着重要的......
随着特高通量DNA测序技术的出现,微生物基因组DNA序列的积累超出了当前注释这些数据的能力范围,基因组注释不可避免地要依靠完全自动......
疾病,特别是复杂疾病,严重影响着人类的身体健康以及正常生活。而癌症作为一种对人类健康具有严重损害的复杂疾病,长久以来一直受......
基因预测是目前计算生物领域非常重要的一个研究课题。虽然目前许多基因预测工具达到了一定的准确率,但在这些工具的使用中,或是由于......
水平基因转移(Horizontal gene transfer,HGT),又称横向基因转移(Lateral gene transfer,LGT),是指在不同的生物个体之间遗传物质......
随着越来越多的物种的基因测序的完成,尤其是人类基因组的测序完成,接踵而至的难题就是对基因组的解释和分析。面对庞大的基因数据......
一个生物体内的大部分基因来自于线性遗传后代,并分享着相同的理论进化过程,但它体内也有相当一部分基因并非源于线性遗传,而是来自水......
黄瓜嫩果皮颜色已经成为影响其商品价值的最重要外观性状之一。本试验所用材料为黄瓜果皮墨绿色高代自交系Q1为父本(P1),乳白色高......
水稻是世界上最重要的粮食作物之一,世界上超过半数的人口以大米为主食。由子囊真菌Magnaporthe oryzae引起的稻瘟病是一种世界性的......
触角是昆虫重要的感觉器官,在昆虫交配、繁殖、迁徙等活动中起着传递信息、感知外界环境的重要作用。触角内存在着大量与气味有关的......
MicroRNA (miRNA)基因是一类新发现的由22个核苷酸组成的非编码蛋白的小分子RNA。越来越多的证据表明miRNA基因在植物的许多生理过......
拷贝数变异(CNVs,CopyNumberVariations)是指基因组中与参考序列相比>1kb的DNA片段插入、缺失和/或扩增,具有分布广泛、可遗传、富......
随着高通量测序技术的快速发展,一种新的方法——RNA-Seq技术被广泛应用于生命科学研究。它主要是针对转录组进行定位定量分析,与之......
黄瓜白粉病是黄瓜(Cucumis sativus L.)生产上的三大病害之一,发病严重时不但降低植株的光合效能,同时影响植株产量和果实品质,因......
在生物试验数据不断积累的今天,如何将数据变为知识和具有预测和推广功能数学模型将是一项十分具有挑战性和有意义的事情。近代机器......
端粒是真核生物染色体末端的重要组成部分,由DNA和蛋白质两部分组成。端粒DNA由一系列重复序列串联而成,包括双链和单链两个部分,......
基因预测在基因组研究中受到越来越多的关注,实际上这个问题就是要用计算的方法在未注释的基因组上精确的指出在DNA序列上的转录,翻......
表现现代基因学特征的各种技术如雨后春笋般的出现,产生了大量与生物学相关的信息,这些信息很快地使生物学变成了一个以信息技术为主......
伴随着基因测序的不断深入发展,多种物种的基因序列面纱被人类逐步揭开,了解基因序列结构特征及功能成为人类日益关注的问题,其中较为......
近年来,随着人类基因组计划的实施,Gene-bank数据库里的基因组序列急剧增长,若要对这些急速膨胀的数据进行完整的分析处理,以及对DNA序......
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主要基于DNA序列的信噪比特征来进行基因识别.首先给出了Voss映射、Z-curve映射以及实数映射下对应的功率谱和信噪比三个公式,并用......
基因决定了我们身体的很多特征,包括头发颜色、血型,对于某些疾病非常敏感等。近日,研究人体生物钟的科学家们发现了一种更加怪异......
讨论了基因组选择的参数模型的不同类型,详细比较了不同收缩方法。介绍了R软件BLR包提供的小麦数据集wheat,建立了该数据集上的贝叶......
从大量的DNA序列中获取丰富的生物信息具有重要的理论意义和应用价值.计算得到了Z-curve与Voss两种映射下功率谱与信噪比的理论关......
利用抑制削减杂交和基因芯片技术获得一批黄孢原毛平革菌特异表达的EST序列,使用Phrap、EMBOSS、Blast、GENSCAN、MZEF软件,基于Li......
多数基因预测算法都会给出预测外显子的分值,但这些分值大多没有意义,很难给使用者带来有用的信息.作者以基因预测程序Fgenes为例,分别......
根据蛋白质编码区周期3行为,设计了两种用于基因外显子预测的窄带自适应滤波器,对基因序列进行滤波处理,获得了外显子的预测曲线;......
运用隐马尔可夫模型,利用Perl编程,以几种模式生物的蛋白质数据库为基础,构建了目标基因的全基因组预测的新方法。该方法具有高通量,准......
数字信号处理技术已经用于DNA(Deoxyribo Nucleic Acid)序列中的基因分析与识别.本文利用数字滤波器对基因序列进行分析和预测,根据......
在这项研究中,我们进行了高通量基因表达数据的荟萃分析,以确定肿瘤坏死因子α(TNF-α)介导基因在肺癌中的意义。我们首先调查了两个独......
为了找出编码蛋白质的基因,注释流程结合了"从头开始的基因预测方法"和"与已知基因相似性比较"这两种方法."从头开始的基因预测方......
基因预测是研究基因功能、基因表达、基因之间的关联关系以及如何控制基因转录等工作的基础。现有的基因预测方法在预测内部编码外......
基因预测是生物信息学领域中的一个重要研究方向。本文在研究了基因局部特征的基础上,针对现有遗传算法在预测基因5'exons方面的不足......
在基因预测时,待研究的生物序列中的残基(氨基酸或核甘酸)具有高度的相关性,因此,观测噪声和马尔可夫链不相互独立的条件下的混合......
基因预测是指预测DNA序列中编码蛋白质的部分.随着多数生物基因组的测序工作的完成,基因预测更显得尤为重要.基因预测主要包括两种......
基于隐马尔科夫模型的算法和基于傅里叶变换的功率谱算法是常用的基因预测方法且准确度较高.对这两种算法加以论述,并做实验比较.结果......
在研究了三种基因局部特征的基础上,针对现有的基因预测方法在预测5’端外显子方面的不足,构建了一种基于统计组合与特征分类的基因......
基因中蛋白质的编码区具有周期三行为这一规律已成为目前基因预测的理论基础,采用功率谱对外显子的周期三行为特征进行了研究,结果......
翻译起始位点(TIS,即基因5’端)的精确定位是原核生物基因预测的一个关键问题,而基因组GC含量和翻译起始机制的多样性是影响当前TIS预......
通过甲基磺酸乙酯(EMS)诱变与遗传分析,从拟南芥(Arabidopsis thaliana)中筛选到一株隐性单基因控制的网状突变体E-210。该突变体植株......
基因结构预测对于发现新基因、了解基因结构规律具有重要作用,是生物信息学领域的重要研究内容之一。对于水稻基因结构,虽然已研发......
针对独立基因预测算法可靠性较差的缺点,提出了真核生物多基因预测结果整合算法(Algorithm for integration of multiple eukaryoti......