辣椒是中国重要的蔬菜和调味品之一，在中国南北蔬菜基地大面积栽培。由于轮作条件的限制，连作或迎茬现象普遍，辣椒连作病害日益严重，引起大量死株，有的地区甚至连年失收。为此，对采自中国辣椒主产区河北的故城、徐水县、望都县、清苑县和满城县，山东的寿光，广西的南宁苏圩镇，四川和海南的长春镇的六省11个连作区土壤病原真菌进行了分离鉴定，并以分离到的致病真菌为靶标，筛选了高效拮抗细菌菌株，并对4株能够产生抗真菌活性物质的拮抗细菌菌株的抗菌机理进行了深入的研究，旨在为有针对性地制定辣椒连作病害的控制策略和措施提供科学依据。主要研究结果如下：　　 1、采用系列稀释涂布法，从11个辣椒连作土壤中共分离到393株真菌。根据形态特征、显微观察和核糖体DNA-ITS序列分析，将其鉴定为16属36种。这些真菌在我国辣椒产区的分布存在明显差异，河北最多，共分离到15属25种，山西5属11种，山东4属8种，广西5属10种，四川4属8种，海南最少，只有3属7种。　　 2、病害侵染试验结果表明，16属36种真菌中共有8属9种171株真菌(占总菌株数的43.5％)能够侵染辣椒，分别是尖孢镰刀菌46株、禾谷镰刀菌11株、贝勒被孢霉47株、辣椒疫霉32株、苹果斑点落叶病菌9株、大丽轮枝菌19株、露湿漆斑菌4株、畸形外囊菌1株、小麦长孺孢2株。其中尖孢镰刀菌、辣椒疫霉、露湿漆斑菌、大丽轮枝菌和畸形外囊菌的致病性较强。　　 3、尖孢镰刀菌是我国辣椒产区连作土壤最重要病原菌之一，该菌已对常用杀菌剂50％福美双可湿性粉剂、70％代森锰锌可湿性粉剂和98％恶霉灵产生了一定的抗/耐药性，即使在同一地区也有较大的抗/耐药性差异。　　 4、采用菌丝块法评价了分自11个辣椒连作土壤的159株细菌以及149株植物内生细菌对植物病原真菌生长的抑制活性，从中筛选到28株(17.6％)土壤细菌和35株(23.5％)植物内生细菌对至少一种病原真菌的生长有抑制作用(抑制率>30％)，其中内生细菌cx120、cx130、cx185和lch56对6种靶标病原真菌生长的抑制率平均大于60％。经形态学观察、生理生化检测和16S rDNA序列分析，菌株cx120、cx130、lch56和cx185被鉴定分别为Bacillus licheniformis、Bacillussubtilis、Bacillus subtilis和Bacillus vallismortis。　　 5、通过摇瓶发酵、有机溶剂正丁醇萃取、TLC-生物自显影追踪抗真菌活性组分以及活性组分的LC/MS分析，初步认为地衣芽孢杆菌cx120和B.vallismortiscx185产生的主要抗真菌活性物质分别为伊枯草菌素类物质(Iturins)和杆菌肽D(BacillomycinD)。