【摘 要】
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文昌鸡产于海南省文昌市,是海南省地方优良品种。文昌鸡存在腹脂过度沉积的问题,腹脂过度沉积会降低屠宰率、造成饲料浪费,因此培育低脂文昌鸡在生产上具有重要意义。本试验以文昌鸡为试验对象,研究了其体脂分布及脂肪沉积规律,为后续文昌鸡脂质代谢的相关研究奠定基础;利用RNA-seq技术,比较分析不同时期文昌鸡腹部脂肪组织转录组的差异,并结合加权基因共表达网络分析（Weighted Gene Co-expre
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文昌鸡产于海南省文昌市,是海南省地方优良品种。文昌鸡存在腹脂过度沉积的问题,腹脂过度沉积会降低屠宰率、造成饲料浪费,因此培育低脂文昌鸡在生产上具有重要意义。本试验以文昌鸡为试验对象,研究了其体脂分布及脂肪沉积规律,为后续文昌鸡脂质代谢的相关研究奠定基础;利用RNA-seq技术,比较分析不同时期文昌鸡腹部脂肪组织转录组的差异,并结合加权基因共表达网络分析（Weighted Gene Co-expression Network Analysis,WGCNA）筛选影响文昌鸡腹脂沉积重要候选基因,本试验的主要结果如下:1.文昌鸡体脂分布及沉积规律的研究以27日龄、79日龄、105日龄和笼养育肥8周文昌鸡为试验材料,分析其体脂分布及脂肪沉积规律,结果如下:脂肪在腹部、皮下和肌肉中的沉积量随着日龄的增长而显著升高（P＜0.05）;文昌鸡腹脂率随着日龄的增长而显著升高（P＜0.05）,皮下脂肪厚度在育肥8周时达到最大;胸肌肌内脂肪、腿肌肌内脂肪含量在育肥8周时达到最大;肝脏内粗脂肪含量随着饲养日龄的增加而显著增加（P＜0.05）,并在105日龄时达到最高。2.不同时期文昌鸡腹部脂肪组织转录组测序结果（1）27日龄与79日龄文昌鸡腹部脂肪组织转录组比较分析,共筛选到300个差异表达基因（DEGs）。GO分析发现DEGs主要富集在细胞器裂变、主轴总成等过程;KEGG分析显示DEGs主要富集在轴突引导、粘着斑等通路。（2）27日龄与105日龄文昌鸡腹部脂肪组织转录组比较分析,共筛选到261个DEGs。GO分析结果显示,DEGs主要富集在肌肉收缩、肌节组织等通路;KEGG分析结果显示DEGs主要富集在糖酵解、甘油脂代谢等通路。（3）27日龄与育肥8周文昌鸡腹部脂肪组织转录组比较分析,共筛选到958个DEGs。GO分析结果显示,DEGs主要富集在多细胞有机体过程、染色体分离等通路;KEGG分析结果显示DEGs主要富集在轴突引导、嘌呤代谢等通路。（4）79日龄与105日龄文昌鸡腹部脂肪组织转录组比较分析,共筛选到35个DEGs。GO分析结果显示,DEGs主要富集在主轴总成、胞质分裂等通路;KEGG分析结果显示DEGs主要富集在溶酶体、细胞衰老等通路。（5）79日龄与育肥8周文昌鸡腹部脂肪组织转录组比较分析,共筛选到56个DEGs。GO分析结果显示,DEGs主要富集在离子结合、肌肉发育等通路;KEGG分析结果显示DEGs主要富集在雌激素信号通路、Th1和Th2细胞分化等通路。（6）105日龄与育肥8周文昌鸡腹部脂肪组织转录组比较分析,共筛选到314个DEGs。GO分析结果显示,DEGs主要富集在微管运动活动、细胞外基质结合等通路;KEGG分析结果显示DEGs主要富集在细胞粘附分子、非酒精性脂肪肝等通路。3.WGCNA分析结果利用WGCNA方法,分析四个不同时期文昌鸡腹部脂肪组织基因共表达情况,筛选与腹脂性状显著相关的6个中心基因,分别是SOST、ABHD3、CCLI8、SRPX、P2RY2、POSTN。4.RT-qPCR试验验证利用RT-qPCR的方法,验证6个中心基因在不同时期文昌鸡腹部脂肪组织中表达情况,RT-qPCR验证结果与测序结果基本一致。5.候选基因在文昌鸡多种组织中的定性表达分析利用RT-qPCR方法分析SOST、ABHD3基因在文昌鸡多种组织中表达情况,结果显示;SOST、ABHD3基因是广泛表达的基因,在文昌鸡多种组织中均有表达,其中在O组织中表达量最低;ABHD3基因在Cr中表达最高,在GF、PM、CF、MF、SF、L、AF中表达量较高;SOST基因在GF中表达最高,在CF、MF、SF、AF中表达量较高。
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