山西省部分地区猪三种人兽共患肠道原虫分子检测及种群结构研究

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毕氏肠微孢子虫(Enterocytozoon bieneusi)、芽囊原虫(Blastocystis sp.)和隐孢子虫(Cryptosporidium spp.)是三种常见的人兽共患肠道原虫,感染呈全球性分布。当人或动物摄入感染性的孢子、包囊或卵囊时会导致其感染微孢子虫病、芽囊原虫病及隐孢子虫病,这三种病均可引起不同程度的腹泻,不仅危害宿主健康,威胁公共卫生安全,也给养殖业的发展带来阻碍。但目前尚无山西省的猪感染这三种人兽共患肠道原虫的数据。本研究共采集山西省晋北(山阴县)、晋南(稷山县)及晋中(祁县)的养殖猪粪便样品362份,基于毕氏肠微孢子虫的核糖体RNA内转录间隔区(ITS)基因、芽囊原虫的小亚基核糖体基因(Small subunit ribosomal RNA,SSU r RNA)和隐孢子虫的小亚基核糖体18S基因进行巢氏/普通PCR扩增,以评估这三种肠道原虫的感染情况及基因型/基因亚型分布情况;并通过统计学分析,评估这三种肠道原虫感染率与地区和年龄因素之间的统计学差异。结果显示,山西部分地区猪的毕氏肠微孢子虫感染率为54.70%(198/362),芽囊原虫感染率为14.09%(51/362),隐孢子虫感染率为0(0/362)。毕氏肠微孢子虫检测结果:198份毕氏肠微孢子虫阳性样品共鉴定为15个已知基因型(Pig Sp Eb2、Ebp C、Ebp A、Ebp B、pig Eb4、Pig EBITS5、I、Henan-Ⅰ、G、Wild Boar 7、SH10、Ebp D、CHC5、Pig Sp Eb1和CHG19)和1个新基因型(Pig SX-1);其中基因型Pig Sp Eb2是研究地区的优势基因型;遗传发育分析发现,所有基因型均聚集在进化组1群和2群,提示这些基因型可能存在人兽共患风险。芽囊原虫检测结果:研究得到的51份芽囊原虫阳性样品共鉴定为ST1和ST5两种基因亚型,二者均为人兽共患基因亚型,其中ST5在本研究地区中为优势基因亚型。隐孢子虫检测结果:在本研究中的362份粪便样品中,未检测到隐孢子虫感染的存在。综上所述,本研究首次对山西省部分地区养殖猪的毕氏肠微孢子虫、芽囊原虫、隐孢子虫进行了分子流行病学调查和种群遗传结构的研究,并评估了感染风险因素。研究结果不仅填补了山西省猪肠道人兽共患原虫的流行病学数据空白,也为当地猪肠道原虫感染的预防和控制提供了科学依据,并具有重要的公共卫生意义。
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