系统性红斑狼疮两种中性粒细胞分子分型以及相关标志物的鉴定

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huangpeifei
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目的:本研究旨在对多个数据集进行分析,利用生物信息学方法建立基于中性粒细胞相关亚型的狼疮分子分型,更全面地展现不同亚型的临床特征、免疫浸润、相应通路和关键基因的关系,进一步分析免疫治疗的效果。方法:采用已发表在国家生物技术信息中心中的高通量基因表达数据库数据集,使用R语言及与所获取数据相匹配的R包进行数据分析及绘图。主要通过免疫细胞浸润和加权基因共表达网络分析研究系统性红斑狼疮的免疫特性。首先,利用加权相关网络分析和单样本基因集富集分析处理系统性红斑狼疮表达数据,并识别与中性粒细胞相关的模块。随后对四个基因集中分析得到的生物学标志物进行鉴定,并以此将系统性红斑狼疮重新分类为两种分子亚型,评估了每种亚型中细胞浸润、分子机制和标志性通路。结果:本研究利用生物信息学方法筛选出与系统性红斑狼疮患者中性粒细胞相关的8种生物标志物(CMTM2、FOS、PIK3CB、SOS2、TLR4、IL18R1、CMTM6、FPR1),并发现筛选得到的生物学标志物在免疫反应中具有协同作用,其中IL18R1可能作为疾病活动的不利因素。随后依据中性粒细胞相关基因的表达量将SLE分为不同亚型,发现高中性粒细胞组富集的通路与SLE致病与活化相关,为后期基础实验支持开创性分类提供理论依据。药物预测发现目前尚未用于治疗SLE的药物PD-98059存在能够缓解狼疮症状的可能性。结论:本研究不仅为狼疮患者进行了分型,同时对免疫治疗提供了新的细胞和基因靶点,为探索其他自身免疫疾病免疫治疗提供了新思路。
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