合作现象是生物化学中非常重要的现象，它反映了小分子底物与酶结合时对酶与底物结合能力的影响。通常合作现象会使产物产生速率-底物浓度的图像呈S形，这有利于生物体用以加强对新陈代谢的调控能力。本文简单介绍了一下细胞内钙离子的调控机制，通过著名的MWC模型阐述了如何从激发抑制角度来定义合作的概念，并且对钙动力学中的IP3R这个模型进行了比较详细的描述，然后通过详细计算讨论其一个子单元中的各位点之间的合作。由于子单元处于非平衡态，因此其中的合作现象与平衡态时的情况有着明显的不同，位点之间的合作性不仅与各状态之间的化学反应速率有关，而且与底物的浓度有关，因此就有可能出现转换现象，即随着底物浓度的变化，位点之间的合作会从正合作变成负合作，或者从负合作变成正合作。由于在计算过程中我们要用到一个很重要的工具--马氏链的环流分解定理，因此，本文也对这个定理进行了简单的叙述。