不同发育时期意大利蜜蜂咽下腺中长链非编码RNA的差异表达研究

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蜂王浆是蜜蜂重要的蜂产品之一,主要由蜜蜂工蜂咽下腺合成分泌。工蜂咽下腺是位于工蜂头部前端的一对葡萄状腺体,其发育具有明显的年龄和行为依赖性:新羽化工蜂(newly-emerged bee,NEB)咽下腺发育不全,无分泌活性;哺育蜂(nurse bee,NB)咽下腺发育完全,泌浆能力强;而采集蜂(forager bee,FB)咽下腺开始萎缩,分泌各种在蜂蜜酿造过程中发挥重要作用的糖转化酶。探究蜜蜂咽下腺年龄和行为依赖性发育机理一直是蜂学领域的研究热点。长链非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)是一类长度大于200 nt的非编码RNA,研究表明lnc RNA在蜜蜂劳动分工、级型分化和免疫防御等生理过程中均发挥重要作用,而其在蜜蜂咽下腺发育过程中发挥的作用还未可知。本研究运用RNA-seq技术检测不同发育时期意大利蜜蜂(NEB、NB和FB)咽下腺中lnc RNA的表达情况,通过生物信息学方法挖掘差异表达lnc RNA,并预测其可能作用的靶基因及相关功能。具体结果如下:1.对三个不同发育时期意大利蜜蜂咽下腺进行RNA-seq,共检测到6255个lnc RNA和28120个m RNA。在NEB和NB咽下腺中有183个lnc RNA和1648个m RNA表达差异显著(p<0.05);在NB和FB咽下腺中有407个lnc RNA和1346个m RNA表达差异显著(p<0.05);在NEB和FB咽下腺有495个lnc RNA和530个m RNA表达差异显著(p<0.05)。2.对三个不同发育时期意大利蜜蜂咽下腺中差异表达m RNA的GO/KEGG分析发现,差异表达m RNA聚类在转录调控,DNA模板化、RNA聚合酶II对转录的正向调控、ATP结合和锌离子结合等功能,富集在核糖体、剪切体和内质网中的蛋白质加工等通路,说明差异表达m RNA通过调控这些功能和通路在不同时期意大利蜜蜂咽下腺的发育过程中发挥重要作用。3.对三个不同发育时期意大利蜜蜂咽下腺中差异表达lnc RNA靶基因的GO/KEGG分析发现,差异表达lnc RNA靶基因聚类在转录调控,DNA模板化、RNA聚合酶II对转录的正向调控和ATP结合等功能,富集在ABC转运、半乳糖代谢和TCA循环等通路,说明差异表达lnc RNA靶基因通过调控这些功能和通路在不同时期意大利蜜蜂咽下腺的发育过程中发挥重要作用。本研究主要探究不同时期意大利蜜蜂咽下腺中lnc RNA的表达差异情况,为不同发育时期意大利蜜蜂咽下腺中lnc RNA表达研究提供理论依据,在一定程度上推进王浆优质高产蜂种的选育和推广。
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