大肠埃希菌噬菌体SZH-1的分离鉴定及基因组分析

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抗生素是防控细菌的主要手段,但抗生素的选择压力,导致敏感菌株被杀灭,耐药菌株被筛选出来并逐渐成为流行中的优势菌种。而新型抗菌药物的研发速度无法对抗耐药菌株的流行,导致常见抗菌药物无法治疗耐药菌的感染,人类面临重回“抗生素前时代”。裂解性噬菌体是可以裂解、杀灭特异性的宿主菌的细菌病毒,是自然界赋予平衡细菌的微生物,目前已经成为代替抗生素对抗细菌感染的重要选择之一。大肠埃希菌是一种普遍存在于人类和动物体内的正常微生物群落,但在一定条件下会引起人类疾病,据世界卫生组织公布急需寻找抗生素替代药物的细菌感染目录中,包括埃希菌属在内的耐药性肠杆菌科细菌位居前列。在本研究中,我们尝试从医院污水中分离针对大肠埃希菌的噬菌体。经过涂布验证,应用双层琼脂法纯化得到了一株裂解性噬菌体,并将其命名为SZH-1。通过透射电镜观察,SZH-1由头部、尾部、尾丝及包裹在头部内部的核酸组成,噬菌体全长为160nm;头部呈二十面体立体对称,直径约为56nm;尾部长约103nm。通过形态,判定该噬菌体属于有尾噬菌体目,长尾噬菌体科。通过测定其相关生物学特性发现,噬菌体SZH-1的最佳感染复数为0.001;其一步生长曲线显示SZH-1的潜伏期为10min,爆发时间是40min;该噬菌体能够裂解40株大肠埃希菌中的11株;且在p H为8时,具有较高的裂解活性,在p H为1-2或者13-14时完全失活。噬菌体SZH-1的基因组为双链环状DNA,全基因组长为44096bp,GC含量为51%。该基因组含有81个开放读码框,26个位于正链,55个位于负链;32个ORF编码产物功能已知,其余编码产物为功能未知的假定蛋白;噬菌体SZH-1基因组无t RNA。总之,本研究分离鉴定了一株裂解性大肠埃希菌噬菌体SZH-1,并对其基因组进行了测序和解读。
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