【摘 要】
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毕氏肠微孢子虫（Enterocytozoon bieneusi）、蓝氏贾第虫（Giardia lamblia）、隐孢子虫（Cryptosporidium spp.）及芽囊原虫（Blastocystis sp.）,均是重要的人兽共患肠道原虫。人和动物主要通过直接或间接摄入带有病原的粪便或饮水等造成感染,引起下痢、体重减轻等临床症状。从地理位置、自然资源和气候条件等方面看,山西省属于典型的农牧交错地区
【基金项目】
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山西省高等教育“1331工程”重点创新团队提质增效建设计划项目（GrantNo.20211331-13）； 山西农业大学高层次人才科研专项项目（GrantNo.2021XG001）；
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毕氏肠微孢子虫（Enterocytozoon bieneusi）、蓝氏贾第虫（Giardia lamblia）、隐孢子虫（Cryptosporidium spp.）及芽囊原虫（Blastocystis sp.）,均是重要的人兽共患肠道原虫。人和动物主要通过直接或间接摄入带有病原的粪便或饮水等造成感染,引起下痢、体重减轻等临床症状。从地理位置、自然资源和气候条件等方面看,山西省属于典型的农牧交错地区,饲草资源丰富,具有发展肉牛产业的天然优势。然而,肉牛一旦被这四种肠道原虫感染,在很长一段时间内都会影响肉牛的生长,严重阻碍养殖业的发展。同时,被感染的动物也会排出虫体,进而污染水源和食物,造成病原的进一步传播。近些年,我国对肉牛肠道原虫的感染情况报道较少,且还不清楚山西省肉牛上述四种人兽共患肠道原虫的感染情况,本研究通过对2020年冬季在山西省晋中地区（祁县）及晋南地区（稷山县）采集的401份肉牛粪便进行毕氏肠微孢子虫、蓝氏贾第虫、隐孢子虫及芽囊原虫的分子检测及种群结构分析,以期了解山西省部分地区肉牛感染这四种肠道寄生虫的现状,为山西省防控人及动物的人兽共患肠道寄生虫感染提供参考依据。本研究针对毕氏肠微孢子虫核糖体RNA的内转录间隔区（internal transcribed spacer,ITS）,蓝氏贾第虫谷氨酸脱氢酶（Glutamate dehydrogenase,gdh）、β-贾第素（Beta-giardin,bg）、磷酸丙糖异构酶（Triose phosphate isomerase,tpi）基因位点,隐孢子虫基于18S和Gp60基因位点,分别对401份肉牛粪便DNA进行巢氏PCR扩增,通过测序及序列分析确定其基因型及在山西省部分地区的流行情况。针对芽囊原虫的SSU r RNA基因位点,进行单轮PCR扩增,通过测序及序列分析确定芽囊原虫基因亚型及其在山西省部分地区的流行情况。结果显示,山西省部分地区肉牛毕氏肠微孢子虫流行率为22.44%（90/401,95%CI:18.36-26.53）,蓝氏贾第虫流行率为14.71%（59/401,95%CI:11.25-18.18）,隐孢子虫流行率为4.47%（19/401,95%CI:2.66-6.82）,芽囊原虫流行率为19.70%（79/401,95%CI:15.81-23.59）。通过序列比对分析,共发现八种毕氏肠微孢子虫基因型,其中六种为已知基因型,分别为:I（n=50）、BEB4（n=20）、J（n=10）、BEB6（n=3）、BEB8（n=4）、Pig Sp Eb2（n=1）和两种新基因型CSC1（n=1）、CSC2（n=1）;发现两种蓝氏贾第虫集聚体,基因分型分别为:E1（n=51）、E35（n=3）、E37（n=2）、E40（n=1）、E41（n=1）、A1（n=1）、A2（n=1）;发现一种安氏隐孢子虫C.andersoni（n=19）;发现五种芽囊原虫已知基因亚型,分别为ST10（n=48）、ST26（n=19）、ST14（n=6）、ST1（n=3）、ST21（n=2）和一种unknown subtype（n=1）。本研究首次报道了山西省部分地区肉牛粪便中毕氏肠微孢子虫、蓝氏贾第虫、隐孢子虫及芽囊原虫的感染情况基因型分布,这些研究结果不仅填补了山西省肉牛人兽共患原虫肠道感染的空白,而且为有效防控肉牛肠道原虫病提供了基础数据。
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