妨害传染病防治罪是我国九七年三月十四日第八届全国人民代表大会,第五次会议审议通过的修订刑法典中新增加的一项罪名,在新冠疫情爆发后,本罪在司法领域的适用频率较之以前提高。新冠肺炎是一种由新型冠状病毒感染引起的急性呼吸道传染病,二0二0年三月十一日,世界卫生组织总干事谭德塞公布,该组织认为当时新冠肺炎可被称作全球性流行病。因此可以说,新冠肺炎疫情是自二00三年“非典”疫情以来,爆发规模最大的一次疫情。通过这次新冠肺炎疫情防治,使大家意识到大规模爆发传染性疾病对国家建设、社会安全、个人生命安危的影响,可能比我们预想的更为广泛。疫情期间,由于违反疫情防控措施的犯罪行为发生率提升,此罪名在司法机关审判上述犯罪活动中的使用率也日益提高。二0二0年最高人民法院、最高人民检察院、公安部、司法部联合制定《关于依法惩治妨害新型冠状病毒感染肺炎疫情防控违法犯罪的意见》（下文简称《意见》）,使该罪名在司法实践活动中适用更加广泛。但是,现行刑法对于此罪的规制仍存在认定模糊性,在行为主体划分、主观心理是否为过失、危害行为前置性规范为何、危害行为的具体方式、因果关系适用、与危害公共安全类罪名的区分等方面均有争议。本文通过司法认定角度入手对此罪进行分析,从此罪名犯罪构成的四要件入手,并结合当前主要观点、相关案例及个人见解对其作出界定,从罪与非罪角度出发对本罪的司法认定要件进行详细评述,区分此罪与危害公共安全罪项下子罪名,为本罪的司法认定尽绵薄之力。文章正文的行文脉络主要为总分总式,总括为四个部分:第一部分,妨害传染病防治罪概述。首先对本罪的立法沿革进行介绍和释明,按法律位阶以及出台先后的次序,详细介绍《刑法》关于本罪于不同时期的相关规定,并分别阐释二00三年五月十四日两高出台的《最高人民法院、最高人民检查院关于办理妨害预防、控制突发传染病疫情等灾害的刑事案件具体应用法律若干问题的解释》（以下简称《解释》）、《意见》的地位以及关系,为研究本罪的司法适用提供规范依据,后半部分详细归纳中外司法适用现状,并提炼在国内本罪在司法适用界域的系列难题,并对上述问题在后文中进行释法说理。第二部分,妨害传染病防治罪犯罪构成要件分析。由于现行《刑法》对于本罪的主体范围、主观方面为故意还是过失,客观方面规定的行为模式,前置性规范《传染病防治法》在司法实践中是否应作扩大解释,以及行为模式的内涵及外延、疫学因果关系适用等方面具有认定模糊性,导致法院在司法实践中存在适用两难问题。本部分从犯罪主体、主观方面、客体、客观方面四部分进行剖析,意在阐释各部分于司法实践中面临的分歧,从而明晰其司法认定标准。第三部分,妨害传染病防治罪与其他类似罪名辨析,此部分主要从罪名之间的关系、疫情防控背景下构成要件之间的差异方面入手,领略本罪和以危险方法危害公共安全罪、过失以危险方法危害公共安全罪之间的关系,结合相关判决,判析不同罪名间的区别之处,为司法实践中区分上述罪名提供参考。第四部分,妨害传染病防治罪的司法规制。此部分主要针对第二部分和第三部分介绍的司法认定模糊性问题所形成的认定标准进行总结汇总,从限制新冠疫情背景下本罪主体的范围、统一本罪主观认定标准“过失说”、危害行为的范围、深化“疫学因果关系”的适用四个方面进行重要性及必要性说理,在此基础上提出自己的司法建议。