猪脑心肌炎病毒1B蛋白与RAC K1蛋白相互作用的鉴定

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脑心肌炎病毒(encephalomyocarditis virus,EMCV)属于小RNA病毒科,目前小RNA病毒科分为12类,分别是心病毒属,甲型肝炎病毒属,口疮病毒属,肠道病毒属,脊髓灰质炎病毒属,猪水疱疹病毒属,猪脑脊髓炎病毒属等。EMCV属于心病毒属的成员,只有一种血清型,Mengo病毒是脑心肌炎病毒的一个毒株。1945年,Schmidt和Helwig首次在迈阿密从一只突然死于肺水肿和心肌炎的雄性长臂猿中分离出EMCV。门戈病毒的衣壳蛋白VP1和VP2的病毒粒子表面有较深的“凹陷”结构,该结构是病毒衣壳上细胞的受体结合的位点。目前关于1B蛋白的研究也很少,我们只知道有研究确定了1B单克隆抗体上的2个B细胞线性表位,但是1B蛋白的功能还不清楚。所以为了进一步研究1B功能以及进步一研究1B与RACK1的相互作用,本研究通过质粒构建、蛋白表达纯化、细胞融合、亚克隆筛选等方法成功制备了一株具有高特异性和高灵敏性的1B单克隆抗体。酵母双杂交技术是一种在敏感的体内研究蛋白与蛋白之间相互作用的非常有效的方法。它最重要的用途就是从构建的cDNA文库中筛选与已知的蛋白有相互作用的未知蛋白。但是因为造成许多假阳性,所以在生物化学上常用其它体外实验来进一步研究蛋白与蛋白之间的相互作用例如免疫共沉淀、激光共聚焦,亲和层析等。蛋白激酶C1受体(receptor for activated protein kinase C1,RACK1),是色氨酸-天门冬氨酸重复蛋白属的成员。研究证明它与许多蛋白又相互作用,RACK1在癌症变化中起到重要作用,在血管新生的时候和许多人类肿瘤中RACK1的表达被改变。因此RACK1的研究具有重要的意义。目前关于与EMCV病毒蛋白相互作用的宿主蛋白,和蛋白的功能与机制还不清楚。本研究利用酵母双杂交技术共筛选了 1 10个阳性克隆,经过PCR鉴定与测序分析,最终得到了 6个与1B相互作用的宿主蛋白。选择其中的RACK1蛋白做进一步研究,因为酵母双杂交系统存在假阳性,所以进一步用免疫共沉淀和激光共聚焦验证RACK1与1B的相互作用。验证1B与RACK1的相互作用区域为WD6-7。不同EMCV稀释倍数、不同时间EMCV感染可以下调RACK1表达。EMCV复制机制以及RACK1功能的进一步研究奠定基础。
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