细胞周期依赖性激酶2在肺腺癌中的作用和机制研究

来源 :山东大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hechangying1
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:肿瘤微环境(TME)在不同的癌症中起着重要作用。近年来,竞争性内源性RNA网络(ceRNA)假说的提出赋予了编码蛋白基因和非编码基因新的、更为广泛的生物学功能。本研究旨在通过生物信息学方法筛选出细胞周期依赖性激酶2(CDK2)相关预后标记物,并构建其在肺腺癌(LUAD)患者中免疫预后模型、森林图、诺莫模型、ceRNA网络。方法:利用“GEO2R”、“limma”R包分析基因表达综合数据库(GEO)GSE68465数据集和癌症基因组图谱(TCGA)数据库中LUAD相关所有差异表达mRNAs(DEmRNAs)。DAVID和Metascape在线功能富集分析P值<0.01,LogFC>2或<-2的差异表达基因。UALCAN、Prognoscan、Oncomine、TIMER 数据库验证 CDK2 在 LUAD 和泛癌中的表达水平、免疫浸润。TISIDB数据库探索CDK2相关的免疫激活剂和免疫抑制剂,cBioProtal数据库中筛选出上述免疫调节剂相关的基因,GSEA进一步功能及通路分析。结合LUAD患者的临床特征,使用“Survival”、“survminer”、“rms”多种R包构建年龄、性别、肿瘤分期的森林图与诺莫模型。单因素及多因素COX回归构建LUAD中与预后相关的免疫预测模型,同时通过多种在线数据库构建CDK2相关非编码基因介导的ceRNA网络。结果:GEO2R共筛选出250个差异表达基因(DEGs),功能分析展示差异基因参与多种经典肿瘤相关通路,如免疫应答激活、细胞粘附、细胞迁移、P13K-AKT信号通路等。初步证实靶分子CDK2通过PI3K-AKT信号通路促进LUAD的发生与发展,并且高表达CDK2组与低表达CDK2组的LUAD患者生存预后有明显差异(P=5.8e-15)。通过Oncomine、TIMER、UALCAN、PrognoScan 等数据库研究,CDK2 在 LUAD 中的表达水平较癌旁正常肺组织高。泛癌分析进一步显示,相比于正常组织,CDK2分子与33种癌症中的表达、分期和生存期均具有统计学意义。通过TISIDB数据库,我们选择了 CDK2相关的13种免疫抑制剂和21种免疫激活剂,并在cBioProtal数据库中探索出与这34种免疫调节剂相关的48个基因标记物(P<0.05)。GSEA分析显示这些基因参与多种肿瘤信号通路。森林图和诺莫图模型显示了这些LUAD患者的预后(Log-Rank=1.399e-08,一致性指数=0.7)。多因素Cox回归分析,4个mRNAs(SIT1、SNA13、ASB2和CDK2)可用于构建预测模型(P<0.05)。依据风险评分的高低,LUAD患者被分为高风险组与低风险组,两组之间LUAD患者的预后有明显差异(P=6.223e-04)。通过“Survival ROC”R包绘制以上4个mRNAs的ROC曲线,整体的曲线下面积是AUC=0.729(SIT1=0.484,SNAI3=0.485,ASB2=0.267,CDK2=0.579)。CytoHubba 构建潜在生物标志物6lncRNAs-7miRNAs-CDK2 相关的 ceRNA 网络。结论:1.CDK2在LUAD中呈高表达,其高表达与CD4T细胞、巨噬细胞浸润呈正相关,CDK2高表达患者预后不良。2.CDK2参与PI3K-AKT信号通路影响LUAD增殖。目的:前期通过生物信息学方法预测出CDK2参与LUAD众多经典肿瘤相关通路,此部分拟通过体内、体外实验及临床组织标本进一步验证LUAD中CDK2表达、功能、机制及临床特征分析。方法:qRT-PCR与Western Blot的方法检测正常支气管上皮细胞(BEAS-2B,16HBE)和LUAD细胞(H1299,A549,H1975,PC9)中CDK2的表达。设计2种敲减序列,以lipo3000为转染试剂,在H1299细胞和H1975细胞中敲减CDK2表达,A549细胞中过表达CDK2,qRT-PCR和Western Blot分别检测敲减和过表达效率。细胞增殖-毒性实验(CCK8)、划痕实验、侵袭实验、迁移实验、细胞增殖成像(EDU)检测细胞功能。免疫荧光检测CDK2在细胞内表达的位置。构建过表达CDK2慢病毒,qRT-PCR及Western Blot验证A549细胞中过表达效率,过表达成功的A549稳转株进行裸鼠皮下成瘤实验,每3日测量瘤体体积,当肉眼可见实验组与对照组瘤体长径与短径之间有明显差异时,处死裸鼠后解剖的瘤体进行包埋、切片、免疫组化,观察增殖指标Ki-67和CDK2分子在LUAD中表达位置及相对表达量。收集LUAD病人术后新鲜的腺癌组织及癌旁正常肺组织样本,qRT-PCR及Western Blot检测CDK2在LUAD患者癌组织及癌旁组织的表达差异。分析15名LUAD患者的年龄、性别、肿瘤大小、TNM分期。结果:CDK2在LUAD细胞(H1299,A549,H1975)中的表达显著高于正常支气管上皮细胞(BEAS-2B、16HBE),其中H1299细胞表达最高(P=0.0006),H1975细胞次之(P=0.0030),A549细胞次于H1975细胞(P=0.002)。H1299细胞中敲减CDK2效率为敲减序列1:P=0.0026;敲减序列2:P=0.0107;H1975细胞中敲减CDK2效率为敲减序列1:P=0.0003;敲减序列2:P=0.0011。CCK8实验显示H1299细胞敲减CDK2后,48小时和72小时后OD值明显下降,增殖能力明显下降;H1975细胞中敲减CDK2后,72小时增殖能力明显下降。划痕实验显示敲减CDK2后12小时、24小时,H1975细胞迁移能力明显下降(P<0.001)。迁移和侵袭实验均显示敲减CDK2后,H1299和H1975细胞迁移和侵袭能力明显下降(P<0.001)。EDU实验显示H1299细胞中敲减CDK2后增殖细胞数明显减少,具有统计学差异(P<0.01)。qRT-PCR与Western Blot的方法检测结果显示A549细胞中过表达CDK2实验组的CDK2表达明显高于对照组(P<0.01)。CCK8实验显示A549细胞中过表达CDK2后,24小时、48小时、72小时细胞的增殖能力均明显升高。Western Blot方法检测H1975细胞中敲减CDK2后,P-I3K、P-AKT表达量明显下降,A549细胞中过表达CDK2后,P-I3K、P-AKT表达明显升高,总I3K与总AKT未见明显变化。Western Blot方法检测H1299和H1975细胞中敲减CDK2后N-Cad、Vimentin表达下降,E-Cad表达升高。A549细胞中过表达CDK2后,N-Cad表达升高,E-Cad、Catenin表达下降。裸鼠皮下成瘤实验显示过表达CDK2后瘤体体积明显高于对照组。免疫组化显示过表达CDK2组增殖相关指标Ki67和CDK2的表达明显高于对照组(P<0.05)。qRT-PCR与Western Blot方法检测显示CDK2在LUAD患者组织中表达明显高于癌旁正常肺组织。15名LUAD患者中女性占比73%,男性占比27%,肿瘤最大体积为3×2.2×2.0cm,患者TNM分期多为Ⅱ期。结论:1.CDK2在LUAD细胞中呈高表达,促进LUAD细胞增殖侵袭和转移。2.CDK2通过PI3K-AKT信号通路促进LUAD增殖,促进EMT增强LUAD侵袭、转移。
其他文献
癌症是一类威胁人类健康的恶性疾病。近年来,由于生活习性、环境污染等因素,我国患癌风险和死亡率逐年升高。随着对肿瘤及分子药理学、细胞生物学等相关领域的深入研究,免疫检查点抑制剂、肿瘤疫苗、细胞疗法等肿瘤免疫疗法进入人们视野并应用于临床研究。随着研究的进行,发现肠道菌群可有效激活机体免疫,使T淋巴细胞增多,增强PD-1/PD-L1抑制剂的抗肿瘤作用。本课题在前期工作基础上,筛选新合成的化合物,同时研究
学位
进入21世纪,经济全球化步伐加快,全球经济海外并购已掀起五次大规模浪潮。2013年“一带一路”倡议提出后,商业银行在内的很多中国企业参与到全球海外并购中。跨国并购中“七七定律”指的是跨国并购实践中70%都不能达到预期期望值,而其中70%失利于兼并后的企业文化整合,并购后企业文化的整合决定了企业跨国并购的成败。本文主要通过对我国全国股份制商业银行ZX银行对A银行并购案例的研究,在深入研究国内外学者关
学位
南宋建立后,宋廷通过兼职体系、设置常平主管官等方式调整提举常平司结构,最终在绍兴十五年设立的提举常平司中完成了官体与职能的统一。在提举常平司众多属官中,干办公事最受朝廷重视,提举常平司签厅、主管帐司、分司等下属机构也在提举常平司的运作中发挥着重要作用。南宋朝廷试图有序调动常平义仓钱米参与地方市场,使上下兼足。因此宋廷要求提举常平司采取逐年上报数字、批书印纸、督促州县更换陈米、监管发卖籴本所得、与户
学位
农产品批发市场作为农产品流通体系的重要一环,起着保障农产品的供应、形成合理的市场价格、拓展农产品流通半径等重要作用。我国农产品批发市场具有比较长的发展历史,但随着经济、技术的发展,人民对生活质量要求的提升,传统农产品批发市场的发展面临了很大的压力,包括交易方式落后、管理松散以及可能被其他业态替代的可能性。因此新建的农产品批发市场不能再走传统农批市场的老路,必须要探索适应国情、符合行业和消费者需求的
学位
研究目的:肺癌作为常见的恶性肿瘤之一,死亡率位居全球恶性肿瘤之首。组织病理学上肺癌分为非小细胞肺癌(Non-small cell lung cancer,NSCLC)和小细胞肺癌(Small cell lung cancer,SCLC)。NSCLC 约占肺癌的 83%,而肺腺癌(Lung adenocarcinoma cell,LUAD)是NSCLC最常见的病理类型。LUAD的发生是多因素、多个基
学位
我国是制碱大国,联碱法制碱的产量占纯碱总产量的40%以上。联碱法将合成氨与氨碱法制碱两工艺联合起来,在生产纯碱的同时,副产大量的氯化铵。氯化铵在几种应用领域内,需求量都很小。因此研发氯化铵进一步转化再利用的方法,提高其附加值,解决氯化铵的出路问题,对于推动制碱业的可持续发展具有重要的意义。氯化铵的转化方法中,与低碳醇反应合成氯甲烷具有反应温度相对较低、转化率高、产品附加值高等特点,适合于大规模工业
学位
党建工作高质量发展是公立医院贯彻落实新时代党的建设总要求的具体任务,也是新发展阶段公立医院改革发展的必然选择。当前,公立医院党建工作存在“重制度轻机制”“重业务轻党建”“重形式轻实效”“重考核轻结果”的实践误区。对此,公立医院党建工作要以政治建设为根本,强化“三个融合”,建设高素质专业化党务干部队伍,创新党建工作绩效考核评价机制,进一步压实党建工作责任,实现从高速发展到高质量发展的转变。
期刊
BLT公司所属的化工行业一直以来都是我国的支柱行业,对国家的经济贡献可谓举足轻重。作为化工行业的新星,BLT公司是一家包括了研发、生产、销售、服务等相关产业链的集装箱液袋生产企业,所属液袋产品属于化工行业的下游分支。作为传统的行业,化工行业市场细分越来越强,企业面临的经营环境日新月异,随着环保、安全监管更加严格,行业竞争日趋激烈。液袋产业随着大量企业的涌入,例如朗夫(LAF)、越海液体货物包装(T
学位
在全球经济多元化发展的推动下,科技水平不断进步,商业银行零售业务的服务群体、覆盖范围以及增速均呈现前所未有的上涨趋势,银行业经营思维发生了根本变化,零售转型乃大势所趋:一是因为零售业务比较稳定,服务对象较多且分散,交易零星,金额较小,流动性风险较低。二是零售业务的发展符合当前中国经济的发展趋势,后疫情时代,在“以国内大循环为主体、国内国际双循环相互促进”的新发展格局下,经济稳定复苏,为零售业务的发
学位
目的探究本中心原发免疫性血小板减少症(ITP)患者的临床特点及对治疗的反应。方法收集2018年1月-2021年12月就诊于山东大学齐鲁医院的141例原发免疫性血小板减少症患者的临床资料,诊断标准符合《成人原发免疫性血小板减少症诊断和治疗中国指南(2020年版)》。主要观察指标包括:患者病程、分期分级、性别、年龄、出血症状、合并症、辅助检查结果、治疗药物等指标。采用IBM SPSS23.0软件进行统
学位