MRPL35在透明细胞性肾细胞癌中表达及其功能的研究

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研究背景:肾细胞癌(Renal Cell Carcinoma,RCC)是肾小管上皮细胞来源的肿瘤,约占肾癌的90%以上,其中以透明细胞性肾细胞癌(Clear Cell Renal Cell Carcinoma,ccRCC)最为常见,约占肾脏肿瘤的65%~70%。局限性ccRCC五年生存率约为65%,但是转移性ccRCC生存率为10%~20%。局限性ccRCC主要是通过外科手术切除治疗,但对于转移性ccRCC需要根治性切除后进行辅助治疗。但是由于不同患者及肿瘤的异质性,多数患者2年后出现疾病的进展,约30%~40%患者缺乏有效的药物治疗或出现耐药而死于转移性疾病。因此发现新的标志物或针对不同患者的精准治疗的要求愈发明显。线粒体核糖体蛋白(Mitochondrial Ribosomal Proteins,MRPs)是一组由细胞核基因编码的蛋白质,在线粒体内组装完成发挥作用,主要参与蛋白质的翻译的过程,但随着肿瘤MRPs的研究,人们发现多种MRPs参与肿瘤的发生与发展。因此,发现MRPs在ccRCC中的差异表达,以及探讨蛋白与肿瘤发生、发展过程中的作用,为ccRCC诊断、治疗和预后提供新的方向。目的:通过TCGA数据库对ccRCC大样本RNA-Seq进行生物信息学分析,分析与ccRCC预后密切相关的MRPs,并通过构建组织芯片和RT-q PCR进行验证。并通过生物信息学分析目的基因的功能。方法:(1)通过TCGA数据库分析ccRCC中肿瘤组织和正常组织差异表达的MRPs有关的基因。(2)通过构建组织芯片免疫组化和实时荧光定量PCR验证差异基因的表达情况。(3)分析差异表达基因与ccRCC患者的临床病理学特征之间的关系,探讨其对肿瘤预后的相关性。(4)通过TCGA数据库分析MRPL35相关性基因,进行相关基因的富集分析并构建PPI网络,寻找MRPL35可能的作用机制。结果:(1)分析TCGA数据库筛选出11种差异表达显著的MRPs,通过Log-rank检验显示MRPL35表达与ccRCC患者预后密切相关(P<0.001)。(2)通过构建组织芯片免疫组化和RT-q PCR验证了肿瘤组织中MRPL35的表达水平较正常组织低。(3)ccRCC中MRPL35低表达较MRPL35高表达患者的预后差。(4)ccRCC中MRPL35表达与线粒体氧化呼吸作用密切相关。结论:MRPL35在ccRCC中表达水平下调提示患者的不良预后,可能与线粒体氧化呼吸作用相关,具体机制有待进一步研究。
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