tst基因在儿童金黄色葡萄球菌肺炎中的临床应用价值研究

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:worldwjf
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[目的]检测金黄色葡萄球菌特有的毒力因子,中毒性休克综合征毒素-1的编码基因tst在儿童金黄色葡萄球菌肺炎(Staphylococcus aureus pneumonia,SAP)临床分离菌株中的携带情况,调查tst基因阳性菌株的耐药特征和分子特征,分析tst基因携带情况与儿童SAP病情严重程度之间的相关性,进而对tst基因检测在儿童重症SAP中的实验诊断价值进行初步探讨。[方法]1.收集2018年11月-2020年12月昆明医科大学附属儿童医院SAP患儿临床分离得到的金黄色葡萄球菌共196株,使用实时荧光PCR法检测菌株mecA和tst基因的携带情况,采用VITEK2-Compact系统进行药物敏感性检测并进行耐药情况分析;对所有tst基因阳性菌株作agr分型和MLST分型,并针对tst基因阳性的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)作SCCmec分型;进一步根据MLST结果进行tst基因阳性菌株的亲缘性分析。2.收集整理196株临床菌株所对应SAP患儿的临床症状、生命体征、实验室感染指标检查结果、肺部影像学检查结果以及肺外并发症情况等相关资料,逐一归纳、总结。按tst基因的携带情况将196例患儿分为tst+SAP组和tst-SAP组,分析tst基因携带与儿童SAP临床病情的相关性。3.根据诊疗指南将196例SAP患儿进一步分为重症SAP组和轻症SAP组,分析tst基因阳性菌株感染与儿童重症SAP之间的关联性及关联强度,绘制受试者工作特征(ROC)曲线,计算诊断效能指标评价tst基因检测对于儿童重症SAP诊断效能,并与现用的炎症检测指标WBC、N%、PCT、CRP进行比较。[结果]1.196株金黄色葡萄球菌中共检出tst基因阳性菌株24株,检出率为12.24%;mecA基因阳性菌株59株,被确认为MRSA,其余137株为甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(Methicillin-sensitive Staphylocccus aureus,MSSA)。59株MRSA中检出tst阳性3株(占5.08%),137株MSSA中检出tst阳性21株(占15.33%),差异有统计学意义(p<0.05)。耐药分析结果显示,3株tst阳性MRSA均仅对青霉素耐药,21株tst阳性MSSA对青霉素、红霉素、克林霉素、四环素、左氧氟沙星、环丙沙星、庆大霉素以及复方新诺明的耐药率与tst阴性MSSA无显著差异(p>0.05)。分子分型结果显示,24株tst阳性菌株的agr分型主要以agr1型为主(70.83%,17/24),agr2型及agr3型各有3株(12.5%,3/24),agr4 型有 1 株(4.17%,1/24);MLST 分型分为 12 个 CC群,包含18个ST型,未发现明显优势型别。3株tst阳性MRSA的SCCmec分型均为Ⅳ型。用MLST构建系统发育树对tst阳性菌株进行亲缘分析,系统发育树分为两大分支,Group1和Group2,不同时间段,年龄,性别患儿的菌株在两支均有检出,无明显聚集现象。2.196例SAP患儿中共有tstSAP患儿24例,tst-SAP患儿172例。在临床症状表现上,tst+SAP患儿入院前发热人数占比大于tst-SAP患儿(p<0.05),热峰为39.17±0.77℃,高于tst-SAP患儿(p<0.05);而两者在入院前咳嗽人数、咳嗽天数和发热天数的差异均无统计学意义(p>0.05)。在生命体征方面,tst+SAP患儿呼吸频率显著高于tst-SAP患儿,差异有统计学意义(p<0.05),体温、心率和血压差异无统计学意义(p>0.05)。实验室感染指标的分析显示,tst+SAP患儿中性粒细胞百分比(N%)、CRP以及PCT水平均显著高于tst-SAP患儿,淋巴细胞百分比(L%)、Hb水平低于tsrSAP患儿,差异均有统计学意义(p<0.05),而WBC和PLT两个指标的差异无统计学意义(p>0.05)。肺部影像学检查结果显示,tst+SAP患儿大片渗出灶检出率较高(41.67%),而tst-SAP则主要以双肺纹理粗多,少许渗出为主(57.56%),差异有统计学意义(p<0.05);并发症的发生情况为,tst+SAP患儿肺内并发症发生率高于tst-SAP患儿,差异有统计学意义(p<0.05),最常见的肺内并发症为胸腔积液;tst+SAP患儿肝功能受损以及发生肺外侵袭性感染的比例显著高于tst-SAP患儿(p<0.05)。3.196例SAP患儿中共有轻症肺炎142例,重症肺炎54例。tst基因在重症肺炎组中检出率31.48%,轻症肺炎组中检出率为4.93%,轻重症肺炎间检出率差异有统计学意义(p<0.05),关联强度分析OR值为8.861(95%CI:3.419-22.967)。在本次研究中,轻重症肺炎间WBC差异无统计学意义(p>0.05),重症组N%、CRP、PCT水平明显高于轻症组,差异有统计学意义(p<0.05),进一步比较tst基因及血清N%、CRP、PCT表达水平对重症肺炎的诊断价值,四个指标的ROC曲线下面积分别为0.633、0.678、0.675和0.624。tst基因检测对于重症肺炎诊断的敏感度为31.48%,低于N%,与CRP、PCT 比较,差异无统计学意义;特异性为95.07%,明显高于N%、CRP,与PCT 比较,差异无统计学意义。[结论]1.SAP患儿tst阳性临床分离株主要分布于MSSA中,tst基因携带与菌株耐药性无明显相关性,tst阳性菌株未发现优势分子型别,遗传多样性较高。2.tst基因携带可加重SAP患儿临床病情严重程度。tst+SAP患儿更多出现高热以及呼吸频率加快等临床表现,炎症指标的升高更为明显,肺部感染更为严重,且更容易引起肝功能受损、侵袭性感染等并发症的发生。3.tst基因检测对于重症SAP的鉴别或预判,特异度高但灵敏度较低,在临床应用上存在局限性。
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