内蒙古部分地区奶牛十二指肠贾第虫分子流行病学调查研究

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十二指肠贾第虫普遍存在于世界各地,是一种常见的人畜共患寄生性原虫,一般分为A~H 8个集聚体。奶牛通常可感染A、B、E 3个集聚体,其中集聚体E在奶牛样品中检出率最高。为了解内蒙古部分地区奶牛十二指肠贾第虫的感染情况以及基因特点,于2021年3月至2021年9月对内蒙古部分地区奶牛养殖场和养殖散户进行采样,通过分子生物学方法,对十二指肠贾第虫的感染情况进行分析。实验基于十二指肠贾第虫核糖体小亚基RNA(Small subunit ribosomal RNA,SSU rRNA)基因,通过巢式PCR的方法,对内蒙古部分地区的奶牛养殖点采集的505份样品进行检测。结果显示阳性样品149份,总感染率29.5%,断奶后感染(43.1%)较断奶前(10.68%)更为常见,不同年龄段的奶牛感染率差异极显著(P<0.01)。通过双向测序,基于BLAST同源性搜索,并利用Snap Gene、MEGA等软件对获得的序列参照测序图谱进行比对校正,最终获得146条可信序列。鉴定出2种集聚体:集聚体E(n=133)和集聚体A(n=13)。集聚体E为采样地区奶牛贾第虫感染的优势基因型,占阳性样品比例为91.10%(133/146)。基于贾第虫的谷氨酸脱氢酶(glutamate dehydrogenase,gdh)、磷酸丙糖异构酶(Triose phosphate isomerase,tpi)和β-贾第虫素(β-Giardia,bg)基因位点,选择特异性引物对149份阳性样品进行巢式PCR扩增,分别得到52份、52份和75份阳性结果,阳性率分别为34.90%(52/149)、34.90%(52/149)和50.33%(75/149)。将阳性产物的测序序列,利用软件进行比对、校正、以及构建种系进化树,结合SSU r RNA基因进行序列分析,内蒙古地区奶牛十二指肠贾第虫感染的优势基因为集聚体E(88.59%,132/149),其次为集聚体(A+E)间的混合感染(5.36%,8/149),少数为集聚体A(4.02%,6/149)感染。并利用多位点基因分型(MLG)方法对内蒙古部分地区奶牛贾第虫基因进行亚型鉴定,结果显示该地区贾第虫集聚体E存在较多MLGs,并形成6个亚群。本文首次对内蒙古奶牛十二指肠贾第虫的感染情况、基因及亚型的分布特点进行的较大规模的调查研究,内蒙古部分地区奶牛间G.duodenalis感染优势基因型为集聚体E,也存在集聚体A和集聚体E的混合感染,明确了该地区奶牛G.duodenalis的遗传多样性,填补了内蒙古牛源贾第虫研究的空白,为该地区十二指肠贾第虫的防治奠定基础。
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