【摘 要】
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目的:通过使用16SrDNA检测方法对慢性咽炎患者的咽部菌群进行研究,比较不同临床表型慢性咽炎的细菌群落特征,为慢性咽炎的预防及治疗提供细菌组学相关信息。方法:采用横断面的研究方法,收集2021年5月至2021年9月于深圳市第三人民医院耳鼻咽喉科门诊部诊断为慢性咽炎患者和健康体检者的咽部分泌物。按照入组标准纳入慢性单纯性咽炎组40例、慢性肥厚性咽炎组34例及正常对照组18例。采用16SrDNA检测
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目的:通过使用16SrDNA检测方法对慢性咽炎患者的咽部菌群进行研究,比较不同临床表型慢性咽炎的细菌群落特征,为慢性咽炎的预防及治疗提供细菌组学相关信息。方法:采用横断面的研究方法,收集2021年5月至2021年9月于深圳市第三人民医院耳鼻咽喉科门诊部诊断为慢性咽炎患者和健康体检者的咽部分泌物。按照入组标准纳入慢性单纯性咽炎组40例、慢性肥厚性咽炎组34例及正常对照组18例。采用16SrDNA检测技术对咽部菌群进行测序,数据经聚类后运用生物信息学和统计学进行OTU统计分析、物种注释分析、多样性分析和高级分析。结果:1.OTU统计分析:92例研究样本共获得480个OTU,其中慢性单纯性咽炎组421个,慢性肥厚性咽炎组433个,正常对照组408个。物种积累曲线表示当前样本量充足,能够充分反映细菌群落。Rank曲线表示样本总体物种组成丰富度高、均匀度强。2.物种注释分析:三组在六个物种分类水平上的主要物种组成及相对丰度均不同。三组比较关键物种平均相对丰度,其中螺旋体门、杆菌纲、乳酸杆菌目、孪生菌目、链球菌科、紫单胞菌科、链球菌属、卟啉单胞菌属、婴儿链球菌、牙髓卟啉单胞菌差异有统计学意义,P＜0.05。支原体科、支原体属、丁弧酸菌属在慢性肥厚性咽炎组中具有显著性作用;弯曲杆菌科、弯曲杆菌属、莫拉氏菌科、月型单胞菌属在慢性单纯性咽炎组中具有显著性作用;链球菌科、链球菌属在正常对照组中具有显著性作用。咽部菌群在Kegg Level 2水平的代谢通路位于前三位的是辅助因子与维生素代谢、碳水化合物代谢和氨基酸代谢。3.多样性分析:在Alpha多样性分析中,物种稀释性曲线表示当前测序数据量基本涵盖了咽部生境中全部细菌物种。两两分组进行多样性指数比较,慢性单纯性咽炎组与慢性肥厚性咽炎组中代表物种丰富度的Ace指数和Chao指数差异有统计学意义,P＜0.05。三组的Good-coverage指数均为0.999±0.00,进一步说明了样本基因序列覆盖率高,充分反映细菌群落真实情况。在Beta多样性分析中,物种多样性热图、样本聚类树和Pco A图均表示三组样本交叉分布,组间菌群相似度较高,未出现显著的进化关系。两两分组比较Weighted Uni Frac指数,差异均无统计学意义,P＞0.05。4.高级分析:PLS-DA图表示样本建立的分组模型良好。RDA图表示慢性单纯性咽炎组以咽痛、咽干、咽痒和咳嗽为主要症状,慢性肥厚性咽炎组以咽干、咽痒和咳嗽为主要症状。病程与菌群及样本分布相关性最高,知觉压力反之。链球菌属与咽痛和咽痒呈正相关;巨球形菌属、放线菌属、罗氏菌属、颗粒链菌属和纤毛菌属与年龄、咽痒、咽干、咳嗽呈正相关;奈瑟氏菌属、弯曲杆菌属与病程、知觉压力、咽梗阻感呈正相关;嗜血杆菌属、梭杆菌属、二氧化碳噬纤维菌属、卟啉单胞菌属与工龄、年龄、咽干、咳嗽呈正相关。结论:1.16SrDNA检测技术可以高效准确的鉴别人体咽部细菌群落。2.与健康人群比较,慢性咽炎患者咽部细菌群落中存在具有显著性作用和差异的物种。3.慢性咽炎患者咽部菌属与临床症状和人口学特征具有相关性。4.菌群失衡在慢性咽炎的发生和发展中可能具有一定作用。
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