含内含子的核糖体蛋白基因转录起始位点附近单个碱基与两个碱基出现频率的统计分析

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选取69个含内含子的核糖体蛋白基因,抽取其中每个基因转录起始位点附近长度为100个碱基的序列,分析69个基因序列样本单个碱基与两个碱基出现的频率,发现转录起始位点为碱基A的占92.8%,单个碱基出现频率最大的为A,其次是T;两个碱基出现频率最大的为AA,其次是AT.给出由位点状态转移到位点后与位点相邻状态的一步转移概率矩阵P以及由位点前与位点相邻状态转移到位点状态的一步转移概率矩阵P′.引入随机变量计算样本中转录起始位点分别为A,T,C的数学期望,以及出现频率最大的单个碱基分别为A,T与出现频率最小的单个碱基分别为C,G的数学期望,分析转录起始位点与出现频率最大的单个碱基之间的条件分布.含内含子的核糖体蛋白基因中富含单个碱基A,T或两个碱基AA,AT的序列可能有利于基因的转录.
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