2018年我国《环境保护税法》开始正式实施,中国由此开启了税制绿色改革的第一步。《环境保护税法》的制定,既是落实税收法定原则的重要体现,也是逐步推进社会主义美丽中国建设的关键。但是,现行《环境保护税法》并没有对税收的使用制度做出详细的规定,面对日益严峻的环境问题,环境保护税收入的使用层面暴露出诸多不足之处,亟需完善。本文通过阐述环境保护税收入使用的概念、特点以及使用方式,深入探讨完善环境保护税收入使用的必要性,以进一步了解环境税收使用的基础理论。立足于中国环境保护税收入使用制度的现状,总结出当前我国环境保护税收入使用制度面临的以下问题:在使用范围方面,环境保护税收缺乏具体的使用范畴,被“挪作他用”的风险逐渐增大;在使用层级方面,央省地环境税收归属不明确,环境保护税款全部归属于地方政府将无法整治跨区域的环境污染问题;在使用机制方面,税收纳入一般公共预算统筹使用无法保证环保领域资金投入的稳定性;在使用监督方面,我国缺乏严格的税收使用监督制度,不得不面临环保资金使用效率低下和腐败等问题。通过借鉴国外环境税收使用制度的经验,以比较研究法、实证分析法对我国环境保护税收入使用制度进行全面分析,并提出针对性的建议:第一,明确我国环境税收的使用范围,确保税收专用于环保项目支出,防止税款被挪作他用;第二,优化中央与地方财权与事权的匹配度,采取“区别对待、部分共享”的税收归属模式来优化环境税收的使用层级;第三,落实环境保护税专款专用的使用机制,设立环境保护基金,完善环境税收专项支出的预算制度,以确保环保资金使用的专用性;第四,从“政府负责、社会协同、公众参与”三个角度来完善我国环境保护税收入使用的监督机制。通过以上建议的提出,期望充分发挥我国环境保护税收入使用制度的法律效果,并对我国生态文明建设和经济发展有所助益。