成熟期水稻种子脱水速率全基因组关联分析

来源 :中国水稻科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:z57989503
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[目的]籽粒脱水速率直接影响到种子的安全收获和快速干燥。因此生产上选育成熟期籽粒含水量低、脱水速率快的品种,以保障种子质量、降低生产成本。[方法]本研究采用来自82个不同国家和地区的165份水稻核心种质作为试验群体材料,将成熟期种子脱水速率表型与基因型相结合进行GWAS分析,以期为挖掘水稻种质脱水敏感、起调控作用的关键基因,为培育和创制脱水快速品种奠定基础。[结果](1)通过对165份水稻核心种质群体脱水速率性状进行描述性统计分析,结果显示2年脱水速率性状均呈连续性偏正态分布,2年快速脱水的脱水速率性状在年际间具有显著相关性。不同亚群之间快速脱水与慢速脱水速率呈正相关。(2)GWAS关联分析共获得与脱水速率显著关联的SNP 170个、QTLs 36个。通过LD分析获得6个与脱水速率密切相关的QTL,分别为q-Kdr2-3、q-Kdr4-1、q-Kdr4-2、q-Kdr6-1、q-Kdr6-4、q-Kdr10-1。[结论]这些QTL区间内主要候选基因OsPIP1;1、OsTIFY9、OsbZIP48、OsATG8b、OsDREB1C、OsSCP46与水分转运活性、信号转导、转录调控、抗氧化防御密切相关,推测它们与种子脱水速率相关,可作为最优候选基因。
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