通常认为，冲突适应效应包含冲突监测和冲突控制两个认知操作，并且监测冲突的脑区能直接调用控制冲突的脑区。不过，冲突适应效应上较大的个体差异说明，即便个体监测到冲突的出现并不必定导致冲突适应效应。我们据此推测在冲突监测与冲突控制之间还存在关键但尚未知的加工。在一项包括三个系列实验的研究中，我们发现警觉水平会影响认知调节，进一步的功能连接分析显示，警觉水平首先调节了丘脑的激活，进而影响了丘脑与额下回的功能耦合，受到调节的丘脑-额下回功能耦合与行为水平的认知调整有显著关系。这些结果意味着认知调整并非如监测理论所认为的是纯粹认知过程；相反，它涉及到复杂的中介过程(如情绪和唤醒)。最后，我们提出冲突适应效应中的认知调整实质上是一个学习过程，其效率会随着经验的积累而提升。