玉米苗期渍水胁迫诱导根系miRNA应答机理的研究

来源 :2012年全国博士研究生学术论坛——作物学科发展与粮食安全 | 被引量 : 0次 | 上传用户:noonbird
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  本研究选用苗期具有不同耐渍表型的自交系Hz32(高耐渍性)、Mo17(渍害敏感)为研究材料,分别对三叶期沙培幼苗进行渍水胁迫处理,利用高通量测序以及qPCR的方法对miRNA和它们下游的靶基因进行了表达关系的鉴定。利用生物信息学预测miRNA上游启动子区的顺势作用元件,并通过酵母单杂交进行了实验验证,鉴定特异表达miRNA的顺式作用元件及受其负调控的靶基因,旨在揭示玉米苗期在渍水逆境条件下,低氧胁迫诱导根系miRNA快速应答的调控机理。研究工作取得了以下结果:共鉴定了24个与耐渍相关的差异表达miRNA序列,并检测了它们与92个候选靶基因的负调控关系,还验证了其中6个靶基因的miRNA剪切位点。对上游启动子的分析中,共鉴定到18个与低氧胁迫响应及发育相关的顺式作用元件并经由酵母单杂交验证。根据以上结果构建了渍害诱导的miRNA介导的基因调控网络。
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