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目的：1.通过血浆采样、多肽分离，寻找最大化提取、分离血浆多肽的试验方法。2.展示健康组及各鳞癌组多肽序列，并对其鉴定，比较分析正常人和肺鳞癌患者多肽差异，初步筛查肺鳞癌的血清标志物。方法：用能稳定血浆的P100试管（BD公司，美国）收集健康人血清48例，I期NSCLC标本10例，、II期NSCL C患者18例、III期NSCLC患者25例。利用有机溶剂沉淀法及高效液相色谱法（HPLC）分离多肽，利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）展示多肽组并对结果进行测序。通过电喷雾四级杆飞行时间串联质谱（ESI-Q-TOF-MS）对各组样本多肽测序，在NCBI蛋白质（基因）数据库中搜索蛋白或者多肽序列。根据国内外文献参考及MALDI-TOF-MS仪器参数，我们规定有效的ID序列将得分不低于20。将获得的数据进行MS Blast分析。得肺癌病人和健康人血浆多肽组，比对健康人和肺癌病人多肽组差异。结果：1.对于血浆多肽组的几个不同收集方法我们进行了详细的对比分析。由于肺癌样本难于采集，方法研究中所有血浆均为正常人血浆。通过文献,我们进行了加热灭活加高压凝胶过滤收集；乙腈变性沉淀加高压凝胶过滤收集；乙腈/丙酮变性沉淀加高压凝胶过滤收集。三种方法通过实验进行比较，我们发现加热灭活方法中蛋白残留量最高，有机溶解变性沉淀方法优于加热灭活方法，故选择有机溶剂沉淀为优先处理方法。对于有机溶剂沉淀，通过不同乙腈体积倍数沉淀方法发现2.5倍乙腈体积优于其它倍数沉淀方法。故我们选择2.5倍体积乙腈沉淀与混合有机溶剂沉淀进行比较，发现4倍体积乙腈/丙酮/水沉淀优于2.5倍体积乙腈沉淀方法，所以我们最终确定采用乙腈/丙酮/水沉淀方法为多肽组提取方法。同时，我们查阅文献发现，增加氨水复溶以增加多肽组回收率。通过一系列实验，最终确定多肽组提取方法为4倍体积混合溶剂（乙腈/丙酮/水=50/30/20）变性沉淀，变性时间为30分钟，变性温度为室温。2.利用电喷雾四级杆飞行时间串联质谱（ESI-Q-TOF-MS），对样本中所含多肽分子进行测序，比对H组和LC1+2+3组多肽序列并将搜索到的肽段利用blast MS分析。分析后可得到所含肽链对应的蛋白。健康对照组搜索到852个肽段，LC1+2+3组搜索到1125个肽段。两组肽段Scores评分均大于20有21个肽段。蛋白数据库搜索得到对应蛋白。我们利用UniProt(www.uniport.org)筛选出8个有功能蛋白。八个蛋白分别是：metastasis-associated protein MTA1/3、Matrix metalloproteinase-16precursor、Cytokerantin-19、 haptoglobin isoform2preproprotein、 breast cancer type1susceptibility protein isoform4/3/2/1、 growth/differentiation factor15precursor、Complement C3precursor、Complement componment C9。根据每组蛋白emPAI进行非标定量分析，统计得出差异蛋白。故我们推测蛋白Matrix metalloproteinase-16precursor可能为潜在肺鳞癌血清标志物。结论：1.4倍体积混合溶剂（乙腈/丙酮/水=50/30/20）变性沉淀法为提取血浆多肽最有效方法。2.蛋白Matrix metalloproteinase-16precursor可能可以成为肺鳞癌潜在的候选血清标志物。