环庚三烯酚酮类化合物大多由植物和真菌产生,少部分由细菌产生,它们是一类非苯环却是芳香族的七元环状物质,具有广泛的生物活性。红色素rubrolone是一种含有氮元素的环庚三烯酚酮的衍生物,它是由链霉菌Streptomyces echinoruber sp.nov产生的次级代谢产物,分子式为C23H23NO8,相对分子质量为441。它的化学结构非常复杂并且特殊,有五个环状结构,其侧链具有四个羟基,因此其具有很大的极性,易溶于水和甲醇,不溶于无水正丁醇。其在216nm、275nm、421nm和523nm处均有吸收峰,它具有很低的毒性,可以作为食用色素。本研究主要探索红色素rubrolone生物合成途径的研究。在对链霉菌菌株做了菌株鉴定之后,本实验对其发酵培养并分离纯化代谢产物。提取链霉菌的基因组,构建基因文库,用Ⅱ型聚酮合成酶基因的引物作为探针,从基因文库中筛选到了26个可能含有Ⅱ型聚酮合成酶基因簇的cosmids。采取异源表达和基因敲除的技术挖掘生物合成红色素rubrolone的基因簇。对链霉菌的基因组进行高通量测序,根据测序结果对相关基因序列的开放阅读框(open reading fram, orf)进行预测并对相关基因进行分析用以推测rubrolone的生物合成途径。