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本文对5-羟色胺受体的分布、功能及分子生物学知识进行了综述。综合利用了同源模建、药效团方法、长时间的分子动力学模拟和虚拟筛选等多种方法,建立了可以作为筛选激动剂的一个5-HT2C受体活性构象模型。根据这个药效团模型和其他文献报道的结合位点的信息,我们确定了5-HT2C受体与激动剂的结合位点。将激动剂20对接到5-HT2C受体中后,经过长时间的复合物分子动力学模拟,得到一个受体和激动剂复合物的模型。根据我们的药效团模型和已知文献报道的激动剂与5-HT2C受体结合模式信息判断,复合物中的受体与激动剂的结合模式是合理的。
本文采用了分子对接方法和三维定量构效关系方法探索它们的作用机理。这些拟肽化合物在与β分泌酶结合时的空间取向和所采用的构象形式是通过AutoDock3.03确定的。对三维定量构效关系模型和β分泌酶的结合位点进行了对比,CoMFA和CoMSIA场的分布都和β分泌酶结合口袋的结构特征相吻合,能合理解释衍生物的活性的差异与结构的关系。