近几年构建并分析基因调控网络是生物数学领域重要的研究方向之一,这是因为基因调控网络可以直观地呈现出细胞内部基因间的调控关系以及因果关系,人们利用不同的方法分析基因表达数据构建基因调控网络以获得基因之间的相互关系。本文针对两种数据用两种不同的方法构建基因调控网络,并通过对所构建的网络的分析得出新的结论。　　本文的主要内容:　　第一部分,基于互信息理论构建基因的无向调控网。首先,对正常肾组织和患癌肾组织的基因表达数据采用 Wilcoxon秩和检验的方法得到候选基因,然后建立这些基因的互信息网络,再根据两个网络的七个统计量的关系筛选出22个结构关键基因,这些基因被预测为与肾癌有关的致病敏感基因,而且这22个基因中有10个已被证实与肾癌的发生和发展有关。同时,根据GO(Gene Ontology)数据库中的基因注释预测了在肾癌的发展中起到重要作用的五条路径,其中三条已被证实。　　第二部分,提出一种基于逻辑分析理论构建基因调控网络的新方法,并将这种方法应用到酵母的敲除263个基因的基因敲除数据中构建基因调控网,通过将所构建的网络和文献中已经得到的网络进行对比来说明方法的有效性,进而通过对推测出的网络的注释预测出10个转录因子的105个靶基因和调控器。