腾冲嗜热厌氧杆菌复制起始的分子细节及热适应性机制的研究

来源 :中国科学院微生物研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:haley912
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
细菌染色体DNA复制起始的第一步,也是最关键的一步,就是复制起始蛋白DnaA顺序结合到复制原点oriC中特定的识别位点(DnaA Box和AT-rich region),继而形成开放性的复制起始复合物(open replication initiation complex)。这一过程是复杂有序而又受多种方式调控的。为了解细菌在高温条件下复制起始的分子细节及其热适应机理,本论文开展了高温细菌Thermoanaerobacter tengcongensm复制起始蛋白TtDnaA与其复制原点Tt-oriC在高温下相互作用的分子机理研究,进而解析了T. tengcongensis染色体复制起始的基本机制。   腾冲嗜热厌氧杆菌(T. tengcongensis)是我国自主分离并完成全基因组序列测定的第一个原核微生物。该菌具有一些有趣的特征,如它生长在70℃左右但GC含量较低(33%);革兰氏染色阴性但基因组序列里含有革兰氏阳性细菌的特征基因;更值得一提的是,该菌86.7%的基因分布在复制前导链上;且含有两个潜在的引发酶和DNA聚合酶III。   为了研究腾冲嗜热厌氧杆菌的复制起始机制,克隆了其复制原点Tt-oriC,对其进行了精细的遗传分析,发现它含有12个散开分布的DnaA Box。采用RIP mapping的方法确定了其精确的复制起始位点位于DnaA Box8和9之间一段独特的AT—rich region上。接着克隆表达并纯化了复制起始蛋白TtDnaA,研究了TtDnaA与Tt-oriC之间在高温下的互作方式。发现在常温下,单独的TtDnaA蛋白的Domain IV(DNA binding domain)和一个DnaA Box就可以有效的相互作用,但在高温下必须要全长的TtDnaA蛋白和两个或两个以上的DnaA Box才能有效的相互作用,且随着两个DnaA Box之间距离的增加,其亲合力会降低,表面等离子共振实验(SPR)表明这个结合过程反应速率极快,且TtDnaA蛋白是高度寡聚化的。当把TtDnaA蛋白负责寡聚化的motif突变掉,则该突变体只能在常温下与Tt-oriC相互作用,而在高温下则丧失有效互作的能力。另外当腾冲菌TtDnaA蛋白的Domain IV置换成大肠杆菌DnaA的相应部分而Domian I—III不变时,突变体在低温下仍可以和Tt-oriC相互作用,但在高温下则不行。以上实验结果说明TtDnaA蛋白结合到多个紧邻的DnaA Box时的协同性,TtDnaA蛋白自身的寡聚化,以及TtDnaA蛋白高稳定性高亲合力的Domain IV对于其在高温下结合Tt-oriC是必需的。   进一步研究了复制起始位点所在的AT—rich region。采用SPR研究发现,只有ATP—TtDnaA蛋白能够与该AT—rich region特异结合,而ADP—TtDnaA则不行。有趣的是,紧临的DnaA Box6-8能大大增强这种相互作用。最后建立了体外复制起始解链复合物重构体系,分析发现只有ATP—TtDnaA蛋白,而不是ADP—TtDnaA或寡聚化缺陷的突变体,能在AT—rich region解开双链,确定了体外解链所需的最小区域仅包括DnaA Box1-8和AT-rich region。采用引物延伸分析方法,进一步确定解链所发生的精确位置正位于该AT—rich region,与体内复制起始位点测定结果完全吻合。这是国际上第一次较为精细的研究了高温细菌复制起始的分子过程及复制起始的热适应机制。
其他文献
一氧化氮(nitric oxide,NO)作为气体信号分子,其对心血管系统、免疫系统和神经系统的功能调节和在信号传导中的作用已经被广泛确认。其分子机制除了一氧化氮经典的cGMP依赖的信
学位
高三的专题复习,不是简单地对高一、高二新课的知识性重复,而是在对所学知识的整合、归纳的基础上对知识的灵活应用,是把知识作为一种解决具体情境问题的一种工具.虽然高三的
沙蚕作为海陆交错带的关键性物种,常被作为环境污染的指示生物。沙蚕生态毒理学已成为生态毒理学研究中又一大有发展前途的研究方向,而有关其耐受高污染胁迫机理的研究则会促进
水资源短缺和水污染问题严重制约着现代社会经济的可持续发展。农业非点源污染因为危害的普遍性和长期性成为继点源污染之后又一重要的水环境问题,受到了各学科研究人员的广泛
学位
摘要:《义务教育英语课程标准(2011年版)》强调积极的情感态度有利于学生主动学习和持续发展。因此,在小学英语绘本阅读教学中,除了实现让学生获取语言信息、扩充英语知识、掌握语言技能、了解外国文化、增强国家意识、拓展国际视野等目标之外,关注学生的文本情感体验也不容忽视。而优质的绘本阅读材料是文质兼美的作品,蕴含了丰富的人文价值和情感因素。笔者就如何在小学低年段英语绘本阅读教学中落实情感教育目标进行了
近几十年来电力系统迅速发展,电力需求日益增长,电网规模日趋庞大,电网结构和电网的运行模式也变得越来越复杂。然而,相对于社会用电需求的激增以及分布式电源、微电网的快速发展,配电网建设的速度明显滞后,其中无功设备配置不合理、投运率不高等现象所造成的电压质量偏低,网络损耗偏高的问题长期存在。可以预见,围绕配电网的建设,无功设备补偿点的选择和无功设备容量的配置这些课题愈加受到重视。寻找合适的无功补偿位置,
摘要:阅读教学是小学语文教学的基本环节,是学生识字的主要途径。笔者就如何创建高效的阅读课堂进行了相关探索,并提出了相关教学策略:创设情境,激发兴趣;精心设计问题,引导学生阅读;图文结合,提高理解课文能力;利用多媒体进行教学,激发学习积极性;以读代讲,在读中落实教学目标;课外拓展阅读,开阔学生阅读视野。  关键词:小学低年级;阅读教学;教学策略  俗话说:“读书百遍,其义自见。”在教学中教师让学生通
苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis,简称Bt)和蜡状芽胞杆菌(B.cereus,简称Bc)是自然界广泛存在的好气芽胞杆菌,两者的表型和基因型具有极大的相似性,同属于蜡状芽胞杆菌群。
摘要:要提高学生的数学学习能力,使数学课程目标得到落实,就必须加强数学阅读能力的培养,提高学生领会和理解数学语言的能力。文章分析了培养学生的数学阅读能力的几点有效策略:一是培养学生的数学阅读兴趣;二是培养学生的数学阅读技巧;三是培养学生的数学阅读习惯。  关键词:小学数学;阅读能力;教学策略  苏联数学教育家斯托利亚尔言:“数学教学也就是数学语言的教学。”而语言的学习是离不开阅读的,所以,数学的学
摘要:随着核心素养教学理念的不断渗透,小学语文教学不仅要求学生掌握课本知识,同时也对学生的语文核心素养提升提出了全新的要求。因此,学生的阅读教学为广大教育工作者所重视。文章从阅读教学的价值分析入手,针对当前教学之中的不足,提出相应的优化策略。  关键词:小学语文;阅读教学;核心素养  语文是小学阶段的一门重要学科,但是语文教学在核心素养的教学背景下,更是一个开放的教学体系。以课本为载体不断提升学生