MMPs基因启动子区5个SNPs与河南汉族群体CHF遗传易感性的关联研究

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背景慢性充血性心力衰竭(chronic heart failure,CHF)是一种严重影响人类健康的一种疾病。现在人们正在深入探索该疾病发生的分子机制。基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinases,MMPs)活性的增强与表达的改变,对脉管系统及心脏组织的重构产生严重的影响,造成心血管系统的损害,结果将会造成心功能恶化甚至心衰。目的研究MMPs基因启动子区5个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与河南汉族群体慢性充血性心力衰竭的关系,以探讨河南汉族群体慢性充血性心力衰竭发病的分子机制。方法1、样本收集与基因组DNA提取:根据知情同意的原则,收集CHF患者160例,正常对照186例,酚/氯仿方法提取基因组DNA。2、SNPs位点检测及分型方法:采用限制性扩增片段长度多态性(polymerase chain reaction–restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)的方法检测MMPs基因rs2285053,rs243865,rs11568818,rs11225395及rs225207共5个单核苷酸多态性。3、统计学原理分析:将不同的每组基因型及等位基因制成Excle表格,采用病例-对照分析,运用SHEsis软件,将病例组与对照组间频数及频率分布进行比较分析、Hardy-Weinberg平衡检验、单体型推断、比值比(odd ratio,OR)及95%置信区间(confidence interval,CI)计算;并分析3个多态连锁不平衡(linkage d isequilibrium,LD)紧密程度。所有统计检验均为双侧检验,检验水准α=0.05。如果计算结果不符合统计学中的正态分布,通过平方根转换后,进行t检验。结果1、MMPs基因型分布Hardy-Weinberg平衡检验:rs2285053、rs11225395及rs225207 3个SNPs位点的基因及基因型频率在两组人群中符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。rs243865位点基因型全部为CC,rs11568818位点基因型全部为AA,有可能rs243865及rs11568818在河南汉族人群中没有多态性,因此不予分析。2、MMPs基因3个SNPs与CHF之间的相关性:心衰组rs2285053位点的T等位基因频率降低(P=0.043);心衰组rs11225395位点的T等位基因的频率显著降低(P=0.004),OR=1.966[95%CI(1.236-3.129)],TT基因型频率与对照组相比也显著降低(P=0.009);rs225207的G等位基因频率显著增加(P=0.002),OR=0.499[95%CI(0.320-3.779)],GG基因型频率与对照组相比也显著增加(P=0.007)。3、MMPs基因启动区3个SNPs单体型分析:CCG单体型的频率在病例组显著高于对照组(P<0.01),OR=3.436[95%CI(1.888~6.253)]。结论1、与对照组相比,心衰组rs2285053及rs11225395位点的T等位基因频率降低,rs225207位点的G等位基因及单体型CCG的频率升高;2、rs2285053及rs11225395位点的T等位基因可能会降低个体慢性充血性心力衰竭的患病风险,rs225207位点的G等位基因及单体型CCG可能会增加个体慢性充血性心力衰竭的患病风险。
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