福建大头蛙mtDNA全序列分析及在两栖纲系统发生中的应用

来源 :安徽师范大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:renminjie
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本文包括文献综述和研究报告两个部分:一、文献综述概括线粒体基因组的特点及研究进展,详细介绍了GenBank上16种无尾目的线粒体基因组,阐述它们的mtDNA基因排列方式并加以比较。结果发现,除了与脊椎动物典型mtDNA排列方式相同的东方铃蟾、产婆蟾、非洲爪蟾、非洲蛙以及盘舌蟾外,其余11个物种有8种不同的基因顺序。文章对每种重排的基因模式都进行了详细的描述,并给出基因组图便于比较和理解。文中最后分析了这些重排发生的机理。二、研究报告1.福建大头蛙线粒体全序列文章测定了福建大头蛙的线粒体全序列,全长17, 654bp,包括37个基因,13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因和22个tRNA基因以及2部分D-loop区。但它的线粒体基因顺序却与其他两栖动物不同,tRNAGlu移位到D-loop区中,D-loop因此而被分成大小不同的两段。除此之外,还发现ND3基因由于突变而提前终止,比其他物种短了12bp。文中应用TDRL模型来解释tRNAGlu的插入。2.两栖纲三个目的系统发生关系现存两栖纲分为三个目,然而它们之间的系统发生关系仍存在较大的争议。本文选择GenBank上25种两栖动物线粒体全序列,结合我们已测定的福建大头蛙(Limnonectes fujianensis)线粒体基因组全序列,以天鹅和眼镜凯门鳄为外群,用线粒体tRNA基因的合并数据重建系统树。采用PAUP(version 4.0 b10)软件构建MP树,Mega3.1构建NJ树,tree-puzzle5.2构建ML树,MrBayes(version 3.04)构建Bayesian树。结果显示,ML树、NJ树和Bayesian树以较高的自引导值支持有尾目和蚓螈目为姐妹群,而MP树则支持无尾目和有尾目为姐妹群。本文对这两种结论进行了分析,并讨论了其中可能存在的偏差。最后还探讨了基因顺序对蛙形目系统发生关系的影响,指出两者有一定的统一性。
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