万历三十三年（1605年），朱由校出生，其父朱常洛正想借此稳定皇太子的地位。但不出所料，万历帝对皇长孙的出生不以为然，后来甚至还反对朱由校出阁读书。直到万历帝驾崩，朱由校都没有被立为皇太孙。
　　纵观万历帝的一生，可发现其对“储位”有诸多偏执，加之他沉溺酒色、疏于朝政、不明事理，间接导致明末宫廷风波不断。著名的“明末三大疑案”，朝野上下、宫廷内外都牵涉其中，案件背后隐藏的权位之争，则标志着皇权开始衰落、朝政已然失衡。

梃击案谁才是幕后真凶？

　　太子险遭棍打，背后究竟是谁在密谋？
　　万历四十三年（1615年）五月，一男子手持枣木棍闯入大内东华门，逢人便打，一直打到太子朱常洛居住的慈庆宫，伤及守门太监数人，直到在殿前才被制服捕获。万历帝得知此事之后，当即命令御史提审问罪。狂徒名叫张差，御史再三讯问，张差总是胡言乱语、颠三倒四，后移交刑部，经多次审问，张差才供出实情，说他正是受郑贵妃手下太监庞保、刘成指使。仅凭这两名太监的地位和能力，不可能有如此大的胆量密谋此事，于是郑贵妃成了最有嫌疑的始作俑者。
　　此案中，太子险些遇刺，不得不查；而此案关联万历帝独宠的郑贵妃，又不得深问。消息迅速传开，震惊了前朝后宫，面对哗然的舆论，郑贵妃只得在万历帝面前哭泣求情。见心尖上的女人哭得梨花带雨，万历帝立刻出面，极力调解矛盾，一方面假意怒责郑贵妃，一方面迫使皇太子改变态度。几经逼迫，太子朱常洛不得不缓和态度说道：“此事只在张差身上结局足矣。”见太子不再深究，万历帝遂下令严惩张差等人，并强调不许波及无辜人，以此保下了郑贵妃。最终，张差被凌迟处死，庞宝、刘成在内廷被击毙，“梃击案”就这样不明不白地结束了。“梃击案”是否受郑贵妃指使，诸多蹊跷已无从知晓，涉案者与宫内权力之争是否有牵连，至今未有定论。

红丸案一枚神效，一枚毙命

　　泰昌帝朱常洛正当壮年，为何继承大统仅一个月就突然死去？
　　万历四十八年（1620年）七月二十一日，万历帝病逝，39岁的太子朱常洛登基，改年号为“泰昌”。朱常洛因“立储风波”受到万历帝的压制，直到13岁才出阁读书，长期辍读的他文化素养并不高，也没有高雅的爱好，终日在后宫沉迷于酒色。此时，先帝刚走，郑贵妃为保全自己、取悦新帝，从侍女中挑选了8名美姬进献给朱常洛。同时，郑贵妃又竭力笼络泰昌帝的宠妃，即两名李氏选侍中的“西李”——李康妃，二人谋合，欲以美人计请封皇太后和皇后。
　　贪恋酒色的泰昌帝纳8姬后，未出几日，本就虚弱的身体，更是“圣容顿减”。泰昌帝“病急乱投医”，斥退太医院医官，召原郑贵妃宫中的内医、今任司礼监秉笔并掌管御药房的内医崔文升入诊帝疾。服完崔文升开的药后，泰昌帝腹痛肠鸣、大泻不止，一夜间如厕三四十次。崔文升进药之举，令群臣惊诧，舆论认为他是受郑贵妃指使，欲置皇上于死地。一时间内廷乱作一团，太医们更是束手无策。到了第29天，泰昌帝已卧床难起，遂召见大学士方从哲等大臣，先谕册立“西李”为皇贵妃，后立其子朱由校为皇太子，并嘱咐大臣用心辅佐。当泰昌帝问及自己的寿宫（即陵墓）时，大臣们慌乱地说：“御医已禀报，万岁只不过是体质虚弱。”泰昌帝自然不信，又询问鸿胪寺进药的官员为何迟迟不来，大臣奏道：“鸿胪寺丞李可灼自称有仙丹妙药可治帝疾，但诸臣皆以为不可轻信。”泰昌帝惧怕死亡，不听大臣们的劝阻，一心只想求得仙丹。于是宣李可灼进药，泰昌帝服下一丸“仙丹”，四肢暖和，思进饮食，像是仙丹确有神效。泰昌帝病情好转，再次派人催促进药，当他服下第二颗“仙丹”后，于次日，即泰昌元年（1620年）九月一日凌晨猝死。

　　泰昌帝最后吃的药丸呈红色，称“红丸”，“红丸案”一名便由此得来。新帝朱由校迫于舆论压力，罢免未力阻李可灼进药的内阁首辅方从哲，将崔文升发配至南京，贬李可灼充军，此案草草收场。从郑贵妃献美姬，到崔文升进药导致腹泻，再到李可灼两次进药，一枚神效、一枚毙命，桩桩件件，疑点丛生。泰昌帝到底因何而死，始终未解。

移宫案宠妃作乱，官宦当道

　　既胸无点墨，又未曾登临太子之位的朱由校，该如何继承大统？
　　万历四十八年（1620年）七月至九月一日，万历帝、泰昌帝相继去世，年仅16岁的朱由校还没有继位就陷入了前朝后宫的争斗中，这场争斗史称“移宫案”，其中包括两次移宫：一次是“储皇移宫”，另一次是“西李移宫”。
　　泰昌帝朱常洛尚未登基时，朱由校的生母王才人，就因受尽西李凌辱而惨死，但朱常洛非但不深究她的死因，竟还将朱由校交给西李照管。与其母一樣，朱由校从小饱受西李的“侮慢凌虐”，也因此形成了软弱性格。泰昌帝即位后，朱由校随西李一起迁住乾清宫。一个月后，泰昌帝驾崩，西李意识到自己获封皇后的计划落空，便想控制朱由校来巩固自己的地位。于是，西李联合太监李进忠（后改名“魏忠贤”），密谋在乾清宫挟持朱由校，欲争当皇太后以把持朝政。受控期间，朱由校无法自由出入乾清宫，甚至不能去为刚刚驾崩的泰昌帝守灵。
　　此举引起了朝臣们的极力反对，众臣认为要尽快帮助朱由校离开乾清宫，摆脱西李的控制，举行登基大典，才能稳定大局。泰昌帝驾崩当日，杨涟、刘一燝及诸大臣一同赶到乾清宫门外请见皇长子朱由校，商谈即位之事，但均被阻拦。西李此举难免引起众怒，加之一波又一波的奏请实难抵挡，最终朱由校得以与大臣们见面。在众臣的庇护下，朱由校离开乾清宫，到文华殿接受诸臣礼拜，并决定于本月六日举行登极大典。为了保证新帝安全，诸大臣商议得出，让朱由校暂时避居太子宫——慈庆宫，由太监王安护其周全。
　　挟持朱由校的计划落空，西李便提出诸如大臣奏折先交由她过目、封自己为皇太后等要求，但都遭到朝臣们的强烈反对，双方矛盾日渐激化。登基大典日期迫近，直到初五，西李仍无移宫之意。若西李不移宫，便无法如期举行登基大典。最终，杨涟等大臣为防其干预朝事，不顾一切逼迫西李， 太监王安在乾清宫内极力驱赶，西李无可奈何只好移居哕鸾宫。九月六日，朱由校正式登基，改年号为“天启”。
　　新皇帝登基大典如期举行，但“移宫”后的斗争还未结束。移宫后仅仅数日，哕鸾宫失火，经奋力抢救，才将西李母女救出。紧接着，不少反对移宫的官员开始散播谣言，指责朱由校违背孝悌之道，朱由校则在杨涟等人的支持下批驳谣传。至此，“移宫”风波才算落下帷幕。