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2009年3月以来，甲型H1N1病毒已在全球包括中国造成了巨大的危害，所以利用生物信息技术对其进行研究显得十分必要。从NCBI数据库下载中国大陆境内A／swine／H1N1病毒HA基因核酸序列及其编码蛋白序列，利用MEGA4．0软件对核苷酸编码序列构建系统进化树，利用BioEdit软件对蛋白序列进行比对，分析重要抗原位点变异情况，结果显示2010年在广东流行的病毒，从其他地方传播到广东的，而非早期广东流行的的病毒变异而来。2008年福建，山东，北京等地区的病毒传播比较迅速．这些分析结果阐明了中国大陆境内A