人参属植物叶绿体基因组特征和密码子偏好性分析

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为研究人参属植物叶绿体基因组和密码子偏好性,本研究收集了8种人参属植物的叶绿体基因组,对8种植物的叶绿体基因组特征、密码子偏好性和系统发育进行分析。研究显示,人参属植物叶绿体基因组大小在156 064~156 402 bp,大单拷贝区(large single copy , LSC)长度最长,叶绿体基因组大小的差异主要来源于反向重复区(inverted repeat, IR)区域。共线性分析和叶绿体基因组比对分析表明,人参属8种植物ycf1、tRNA-Gln基因差异最明显,但叶绿体基因组未发生重排,结构较稳定。密码子偏好性分析表明,人参属8种植物密码子偏好性主要受自然选择的影响,8种植物使用最多的氨基酸为Leu,最优密码子为5个。系统进化分析,8种植物的两种分类方式一致,符合中国植物志分类。本研究明确了人参属植物的叶绿体特征和密码子偏好性,为人参属的分子鉴定、系统进化和遗传育种提供一定的参考价值。
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