努比亚山羊BMPR-IB基因多态性与其产羔性状的关联分析

来源 :南方农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:erdongzi
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【目的】明确努比亚山羊骨形态发生蛋白受体-IB(BMPR-IB)基因多态性与其产羔性状的关联,为山羊育种寻找新的遗传分子标记。【方法】采用DNA池结合PCR产物直接测序技术检测努比亚山羊BMPR-IB基因全部编码区的变异情况,以时间飞行质谱列阵技术对候选SNP位点进行基因分型,并分析BMPR-IB基因多态性与产羔性状(产羔数、初生重和断奶重)的关联性。【结果】努比亚山羊BMPR-IB基因5’UTR第469位存在A→G碱基突变,内含子1第1664位和内含子9第11344位处存在G→A碱基突变。3个SNP位点(5’UTR 469th、Intron1 1664th和Intron9 11344th)存在3种基因型(GG型、GA型和AA型),对应的多态信息含量(PIC)分别为0.37、0.11和0.37,其中Intron1 1664th位点的基因频率和基因型频率处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),5’UTR 469th和Intron9 11344th位点则处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05)。关联分析结果表明,努比亚山羊BMPR-IB基因5’UTR第469位碱基由A→G,其GG型母羊比AA型母羊的产羔数和子代平均初生重有所减少,但子代平均断奶重增加;内含子1第1664位碱基由G→A,其GA型母羊比GG型母羊的产羔数和子代平均初生重均有所增加,但子代平均断奶重减轻;内含子9第11344位碱基由G→A,其AA型母羊比GG型母羊产羔数少,但子代平均初生重和平均断奶重均增加。可见,努比亚山羊BMPR-IB基因的3个SNP位点对其产羔性状均无显著影响(P>0.05)。【结论】努比亚山羊BMPR-IB基因存在3个SNP位点(5’UTR 469th、Intron11664th和Intron9 11344th),但对努比亚山羊产羔性状影响不显著,说明BMPR-IB基因对山羊的产羔性状具有一定种属特异性。
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