高等学校基金会是随着教育事业与慈善事业发展,为满足高等教育集合社会资源的需要而产生的特殊基金会类型。《民法典》（总则编）第87条确定了基金会非营利法人的民事主体地位,增强了我国民事主体制度的科学性、规范性,为高等学校基金会提供了原则性的法律指引。然而高等学校基金会作为一种特殊基金会类型,不仅具备基金会的法律属性,受到基金会法律制度的规制,还与高校存在密切联系。为强调高校基金会独立性,提高高校基金会募资能力,本文从民事主体制度角度出发,归纳高校基金会的发展历程,从法人治理角度提出高等学校基金会在法律规范、组织机构、法人独立人格方面存在的问题,进行分析并提出完善进路,为高校基金会更好发挥功能提供参考。文章除引言和结语外,共分为四个部分:第一部分,介绍本文的研究背景。文章首先介绍高等学校基金会的概念,高等学校基金会是为高等学校更好地面向社会自主办学,出于吸纳社会捐赠资金、统筹捐赠资源配置、优化高校运行目的,按照法律规定程序设立的独立的非营利性组织。接下来,文章介绍我国高等学校基金会历史沿革、发展现状和分类:我国高等学校基金会起源于教育、财政政策变革,经历了初步探索、蓬勃发展和内涵式发展三个阶段,目前已经具备相当数量,在高校配置教育经费中发挥越来越重要的作用;按照募捐对象,高等学校基金会可以分为公募基金会和非公募基金会,按照发起主体出资性质,可以分为公办高校基金会和民办高校基金会。文章最后从理事会成员构成、秘书处及具体执行部门设置情况、监事成员构成、基金会与其他民事主体关联情况对我国高等学校基金会进行实证考察。第二部分,提出我国高等学校基金会在法人治理中存在的问题。首先,基金会法律规范体系存在内在冲突,包括一般法层面的设计困局和特别法层面的规定误区。一般法存在对基金会法律供给不足和在制度设计上倾向于公法的“管控”角度的问题,特别法上存在基金会法律概念混乱、行政干预力度大的问题。其次,高等学校基金会组织结构科学性遭受质疑。理事会法律属性存在的争议,一是《基金会管理条例》将理事会规定为决策机构的合理性质疑,二是现实中理事会成员绝大多数来源于高校的独立性质疑。监事（会）科学性质疑在于监事职能能否得以实现。最后,高等学校基金会民事主体独立性不明。第三部分,分析我国高等学校基金会在法人治理中存在的问题。首先,对基金会民事主体法律制度进行反思。基金会民事主体法律表达应当与《民法典》非营利法人制度保持一致,基金会法人独立人格的强化可以参考日本法上一般法人与公益法人的划分思路。其次,辨析组织结构的法律属性及职能范围。基金会组织结构设计变化体现出其作为独立民事主体具备越来越多法人的一般特征。理事会根据具体职权内容具备决策机构和执行机构双重属性,而高等学校基金会职能削减的原因来自人事成员身份复合和激励机制不足。监事权的落实可能在于立法加强监事职能设计。最后,讨论了高等学校基金会独立民事主体地位在人事结构关系上的实现。第四部分,提出高等学校基金会法人治理问题的完善进路。首先,完善以《民法典》为指导的统一的基金会法人制度体系,要统一立法术语,减少行政管制、强调私法自治;其次,明确高等学校基金会理事会的法律属性及职能范围,强化监事（会）职权;最后,建立法人独立人格下高等学校基金会与其他民事主体协调合作机制。