Hsa_circ_0001874在胃癌组织的表达及其生物功能预测

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目的环状RNA(CircRNAs)是一种新的内源性RNA,其5’和3’端是共价连接的。随着高通量分子测序技术以及生物信息学的不断进步,人们已经可以检测并鉴定出许多新的circ RNAs。并且研究发现异常表达的circ RNAs与人类疾病息息相关,尤其在胃癌等消化系统恶性肿瘤中发挥着不可忽视的作用。然而,hsa_circ_0001874与胃癌的关系尚不清楚,本研究旨在探索hsa_circ_0001874与胃癌的关系。方法1.选择实时定量逆转录聚合酶链反应(quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction,q RT-PCR)为检测手段。2.检测正常胃粘膜上皮细胞(GES-1)、2种胃癌细胞(BGC-823和SGC-7901)中hsa_circ_0001874的表达水平。3.检测91对胃癌组织及其所配对的癌旁组织中hsa_circ_0001874的表达水平。并建立受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线,评价其在临床上的应用价值。4.分析胃癌组织hsa_circ_0001874的水平与临床病理因素相关性。5.通过生物信息学分析进一步预测hsa_circ_0001874的生物学功能。结果1.Hsa_circ_0001874在胃癌细胞系(BGC-823和SGC-7901)中表达显著降低。2.Hsa_circ_0001874在78.02%(71/91)胃癌组织中表达显著降低。3.构建ROC曲线以组织hsa_circ_0001874表达水平来区分胃癌和癌旁组织,曲线下面积、敏感度和特异度分别为0.673、61.54%和68.13%。4.结合临床病理资料,胃癌组织中hsa_circ_0001874表达水平与细胞分化程度(P<0.001)、肿瘤分期(P=0.005)、浸润深度(P=0.024)、淋巴结转移(P=0.023)、组织癌胚抗原水平(P<0.001)密切相关。5.生物信息学的分析结果表明,hsa_circ_0001874通过种子序列与miR-593-5p、miR-103a-3p和miR-107相互作用从而调控这三个miRNA及其下游靶基,进而参与多种生物学过程和信号通路,如蛋白复合物调控、基因表达、细胞周期、p53信号通路和代谢过程。这些因素都会影响胃癌的发生发展。结论Hsa_circ_0001874是胃癌的一个标志物,通过充当miRNA“海绵”的形式在胃癌的发生和发展过程中扮演着重要的角色。
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