美洲南瓜茎色性状基因的遗传分析与定位研究

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南瓜(2n=2x=40)属于葫芦科(Cucurbitaceae)南瓜属(Cucurbita)一年生蔓性草本植物,具有生长力强,适应性强,容易管理等优点,同时也具有很高的营养价值、药用价值和栽培价值。茎色是南瓜的农艺性状之一,通过对美洲南瓜茎色性状遗传规律及相关基因定位的研究,了解美洲南瓜茎色变化的机理,为南瓜茎色性状的研究提供一定的理论基础。本试验以美洲南瓜深绿茎自交系‘19’和浅绿茎自交系‘113’为亲本构建六世代群体,进行茎色遗传规律分析,利用F2群体采用BSA-seq技术、KASP基因分型和In Del分子标记进行茎色相关基因的定位,结果如下:(1)美洲南瓜茎色性状表型鉴定通过对‘19’和‘113’两个亲本生长发育过程中茎色的变化进行观察,结果显示两个亲本主茎生长至3叶期茎色均为浅绿色,颜色差异不显著,从7片真叶时期开始两个亲本的茎色出现明显差异,亲本‘19’主茎色的变化为渐变式的,子叶节位颜色最深,为墨绿色的,越往主茎的顶端颜色越浅,‘113’的主茎色在整个生长过程中都为浅绿色。对两亲本主茎叶绿素与类胡萝卜素含量测定表明,叶绿素是美洲南瓜茎色的主要色素,茎色与叶绿素含量呈现正相关,茎色越深,叶绿素含量越高,且茎表皮中叶绿素a的含量大于叶绿素b的含量。(2)美洲南瓜茎色性状遗传规律分析以‘19’和‘113’为亲本构建的六世代群体进行茎色性状遗传规律分析,结果表明:F1与F1’的表型全部为深绿茎,F1与‘19’回交后代为深绿茎,与‘113’回交后代为深绿茎与浅绿茎比例为1:1(χ2=0.26,P=0.60),F2个体中深绿茎与浅绿茎植株比例经卡方检验符合3:1分离比(χ2=2.05,P=0.15),表明美洲南瓜深绿茎受一个显性核基因控制,命名为Cp D。(3)美洲南瓜茎色性状基因定位通过BSA-seq技术将美洲南瓜深绿茎色基因初步定位于15号染色体2.08Mb的范围内,在初定位区间内开发KASP、In Del分子标记筛选F2群体,将Cp D基因定位于15号染色体41.4Kb区间内,该区间共包含4个候选基因。通过基因功能注释、序列比对和基因差异表达分析确定Cp4.1LG15g03360和Cp4.1LG15g03420为茎色候选基因。
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