近年来,膨胀显微技术得到快速发展,为观测生物超微结构提供了新的通路。膨胀显微技术通过将生物样品锚定于可膨胀的三维水凝胶网络中,物理膨胀生物样品,让组织精细结构得到放大,使普通光学显微镜亦能实现超分辨成像。为了实现对生物样品结构的可视化,生物学上常对样品进行形态学荧光染色。荧光共价键染色是2020年新开发的适用于膨胀显微技术的形态学染色技术。它利用荧光团对生物组织上的某些特定官能团进行共价键标记,从而揭示生物组织的一般形态学特征。然而,目前荧光共价键染色在各类组织中的成像效果研究还比较有限。而且,适用于膨胀显微技术的共价键染色种类较少,有待进一步开发。针对以上问题,本论文开展了如下工作:（1）用膨胀显微技术与共价氨基染色法结合,对肾、心、肝、脾、肺等多个组织进行超分辨显微结构成像。着重对肾脏组织的超微结构进行成像,并对其病理变化进行了探测,验证了该成像方法的实用性与通用性。（2）运用膨胀显微技术与共价氨基染色法结合,建立了一种新的观测和识别肾小球内各类细胞的方法。该方法在三维组织成像基础上,对肾小球内固有细胞（足细胞、内皮细胞和系膜细胞）的构成比例进行了研究。该方法实现了三维观测肾小球内部细胞的种类。（3）开发出了两种新型化学共价键染色方法,分别用于标记组织上丰富的羧基与酪氨酸残基,拓展了现有的共价键染色工具集。对这两类新染色方法在各类组织中的染色样式进行了探究。验证了这两种新型染色方法在各个组织上的成像效果。