结合临床与实验室资料建立原发性IgA肾病诊断与分级模型的研究

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:marymahoo1985
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
[目的]基于Logistic回归和机器学习算法,利用临床和实验室资料建立IgA肾病无创诊断与分级模型。[方法]1、研究对象:回顾性研究2020年1月至2021年11月于昆明市延安医院、云南省第一人民医院和昆明医科大学第一附属医院肾脏内科接受肾脏病理检查的住院患者。纳入标准:(1)经肾脏病理检查证实为原发性肾小球疾病;(2)所需的临床资料完整。排除标准:(1)未经肾脏病理检查确诊;(2)继发性肾小球疾病;(3)合并严重感染或急性肾功能损害;(4)妊娠、恶性肿瘤、获得性免疫缺陷病或其他自身免疫性疾病。入组患者根据肾脏病理活检结果分为原发性IgA肾病组和非IgA肾病组。原发性IgA肾病组中根据Lee氏病理分级依次分为Ⅱ级、Ⅲ级、Ⅳ级和V级共四组。2、资料收集:采集患者经肾脏穿刺活检时的住院记录。包括患者的性别、年龄、身高、体重、肾脏组织病理学检查结果、血压和有无血尿、白细胞总数(WBC)、血红蛋白(Hb)、总蛋白(TP)、白蛋白(Alb)、尿素(BUN)、肌酐(Cre)、尿酸(UA)、空腹血糖(Glu)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、糖化血红蛋白(HbA1c)、尿肌酐(Cr)、尿葡萄糖苷酶(NAG)、免疫球蛋白G(IgG)、免疫球蛋白A(IgA)、补体3(C3)、补体4(C4)、尿总蛋白、尿白蛋白、尿白蛋白肌酐比值(ACR)。3、利用机器学习算法建立IgA肾病鉴别诊断模型:将原发性IgA肾病与非IgA肾病组共460例患者随机地分为训练集(70%,322例)和测试集(30%,138例)。分别使用决策树、随机森林、支持向量机和XGBOOST算法建立原发性IgA肾病鉴别诊断模型。首先使用Jupyter lab 3.0软件基于Scikit-learn库,导入建立四种模型需要的模块。其次,使用学习曲线或Grid Search网格搜索算法循环遍历得到最优的候选参数。然后,用训练数据集训练模型。训练完成后对测试数据集进行预测。4、诊断模型效能评估:以准确率、受试者特征工作曲线下面积、精确率、召回率和F1评分综合评估各模型效能并选择性能最佳的模型作为最终的鉴别诊断模型。5、利用Logistic回归算法建立分级模型:采用开元统计软件首先对影响IgA肾病Lee氏病理分级Ⅱ至Ⅴ级的指标依次进行单因素、有序Logistic、无序多分类Logistic回归分析。其次,将IgAN患者划分为Lee氏≤Ⅲ级和Lee氏>Ⅲ级两组,分别进行单因素和二元Logistic回归分析,p<0.05为差异有统计学意义。并利用敏感度、特异度评估分级模型的效能。[结果]1、纳入研究的患者共460例,其中原发性IgA肾病232例,非IgA肾病228例。IgA肾病组与非IgA肾病组的男女构成比分别为104:128和120:108,年龄(岁)分别为 36.70(27.00,44.50)、43.32(31.00,54.00)。232例原发性IgA肾病中,Lee氏病理分级Ⅱ级66例(28.45%),Ⅲ级91例(39.22%),Ⅳ级45例(19.40%),V级30例(12.93%)。Lee氏分级Ⅱ~Ⅴ级的男女构成比分别为 31:35、33:58、23:22、17:13;年龄(岁)分别为 39.36(30.00,47.00)、34.21(24.00,43.00)、39.09(29.00,47.00)、34.98(27.00,40.25)。Lee氏病理分级≤Ⅲ级的患者共157例,男女构成比与年龄(岁)分别为64:93、34.00(26.00,44.00);Lee氏病理分级>Ⅲ级的患者共75例,男女构成比与年龄(岁)分别为40:35、36.00(28.00,46.00)。2、与非IgAN组相比,IgAN组血尿发生比例、TP、Alb、Cre、IgG、IgA、C3 水平、IgA/C3 比值较高,而年龄、TC、TG、HDL-C、LDL-C、HbA1c、NAG、尿总蛋白、尿白蛋白水平及尿白蛋白排泄率较低(P<0.05)。3、采用DT、SVM、RF和XGBOOST算法建立鉴别诊断模型,模型效能随参数个数的增加而逐渐提高,最终达到决策边界维持不变。四种模型训练完成后最终的准确率分别为89.86%、87.68%、92.03%和94.93%;AUC值分别为0.90、0.94、0.98和0.99;判断为原发性IgA肾病的F1评分分别为 0.89、0.88、0.90 和 0.95。4、综合以上各评价指标,基于XGBOOST算法建立的模型效能最佳,该模型诊断IgA肾病的敏感度、特异度分别为93.55%、94.74%。白蛋白、IgA/C3比值对模型具有重要贡献度。5、单因素分析结果显示年龄、WBC、TP、Alb、BUN、Cre、UA、尿总蛋白、尿白蛋白、ACR与IgA肾病Lee氏病理分级Ⅱ至V级有显著相关性。舒张压、TP、Alb、WBC、UA、BUN、Cre、尿总蛋白和尿白蛋白与IgA肾病Lee氏病理分级≤Ⅲ级和Lee氏>Ⅲ级显著相关。6、多分类Logistic回归结果显示年龄、Cre、UA、BUN是IgA肾病Lee氏病理分级Ⅱ至Ⅴ级的独立危险因素。二分类Logistic回归结果显示UA、Alb是IgA肾病Lee氏病理分级≤Ⅲ级和>Ⅲ级的独立危险因素。7、分级模型效能评估:多分类Logistic回归模型预测IgA肾病Lee氏Ⅱ-Ⅴ级的敏感度分别为40.91%,76.92%,26.67%,33.33%。二分类Logistic回归模型预测IgA肾病Lee氏≤Ⅲ级的敏感度为91.72%。[结论]结合临床资料和实验室检验结果建立了 IgA肾病与非IgA肾病的鉴别诊断及分级模型,经评价采用XGBOOST算法建立的鉴别诊断模型临床性能最佳。多分类Logistic回归模型预测IgA肾病Lee氏Ⅲ级的敏感度最高,其余分级的模型性能欠佳。二分类Logistic回归模型预测IgA肾病Lee氏≤Ⅲ级与>Ⅲ级相比,其敏感度较高。
其他文献
[目 的]探究阿达木单抗(ADA)联合常规治疗对非感染性葡萄膜炎的临床疗效及安全性,对比用药前后不同时段的炎症等级、最佳矫正视力(BCVA)、黄斑中心凹厚度(CMT)等变化情况,评估ADA的激素节约效应及有效控制时间,对比人白细胞抗原B27(HLA-B27)阳性与阴性前葡萄膜炎患者对ADA的应答情况,对使用ADA治疗的脊柱关节炎患者的葡萄膜炎复发情况进行随访评估。[方 法]临床观察性研究。选取20
学位
[目 的]探讨血液灌流(Hemoperfusion,HP)治疗重度致幻型牛肝蕈中毒的临床疗效,主要通过治疗后患者的神经精神症状消失时间、住院天数、并发症、实验室检查指标进行评价、BPRS评分,为临床上重度致幻型牛肝蕈中毒的治疗提供理论依据。[方法]通过回顾性分析选取2017年1月至2021年12月收治在昆明医科大学第四附属医院(云南省第二人民医院)急诊内科的115例急性重度致幻型牛肝蕈中毒患者的临
学位
[目的]本文以口服百草枯中毒的患者为研究对象,分析不同血液净化方式在改善百草枯中毒患者的肝功能、肾功能以及3个月生存率方面有无差异,为百草枯中毒的临床治疗提供参考依据。[方法]收集昆明医科大学第四附属医院(云南省第二人民医院)急诊内科2016.1.1至2020.12.31符合纳入标准和排除标准的百草枯中毒病例资料进行回顾性研究,共405例。在一般治疗的基础上(洗胃导泻、使用激素及免疫抑制剂、抗氧化
学位
[目 的]本研究以我国HIV-1感染的长期不进展者为研究样本,从中分选靶向HIV-1的中和抗体并分析其可变区序列特征和功能活性。随后通过基因工程技术将分选的中和抗体改造为IgM形式。了解改造后的IgM抗体亲和力和中和活性的改变。探索IgM类抗体在HIV-1被动免疫治疗领域中的应用价值和范围。为诱导保护性IgM抗体为目标的疫苗提供一定的理论基础,为艾滋病的防治提供新的思路。[方 法](1)采用单个记
学位
[目的]1.调查昆明地区碳青霉烯类耐药铜绿假单胞菌(Carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa,CRPA)的耐药状况,分析生物膜形成能力和外排泵系统与抗生素耐药性的关系。2.探讨铜绿假单胞菌生物膜与外排泵相关性,研究生物膜菌与浮游菌外排泵表达差异,探索外排泵抑制剂(Efflux pμmp inhibitor,EPI)PAβN对铜绿假单胞菌生物膜产生的影响
学位
[目 的]研究分析基于不同抗病毒治疗方案治疗HIV/AIDS患者,48周后病毒载量≥1000copies/mL的患者其血项、肝功、肾功、免疫水平等多项指标,以及HIV-1病毒pol区基因变异的规律,为评估HIV抗病毒治疗疗效及用药后不良反应,指导临床医生优化治疗方案提供理论依据。[方 法]本研究选取2016年1月~2020年12月间在云南省传染病医院接受抗病毒治疗满一年的艾滋病感染者(HIV)/艾
学位
[目的]真菌性角膜炎是由真菌感染引起的一种严重的角膜盲病,近年来在我国的发病率逐年上升,是我国角膜盲的主要原因,因缺乏快速且有效的诊断方法,抗真菌治疗困难、常预后较差。由于我国各地区自然环境、卫生状况、诊疗水平、经济发展等不同,真菌菌种的分布、流行病学特征、临床表现及疾病预后情况在不同地区存在差异。本研究拟对676例真菌性角膜炎患者的临床资料进行回顾分析,以期提高云南地区真菌性角膜炎的诊疗水平。[
学位
目的:分析恶性胆道梗阻 125I粒子支架植入术后并发胆道感染发生的危险因素,为临床预防和治疗胆道 125I粒子支架植入术后合并胆道感染提供依据。方法:回顾性分析2014年1月-2020年12月诊治的231例恶性梗阻性黄疸(Malignant biliary obstructive,MBO)(如:胆管癌、胆囊癌、胰腺癌、原发性肝癌、转移癌等)并且行胆道 125I粒子支架术的患者进行研究,按照纳入和排
学位
[目的]近年来碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)检出率逐年上升,其在医院内迅速传播和局域性暴发给临床抗感染治疗带来了严峻挑战。CRKP中高耐药、强毒力菌株的致病性往往导致临床预后较差。肠杆菌素铁载体能影响CRKP的毒力水平,是CRKP重要的致病因素。本研究旨在探索cAMP受体蛋白(cyclic AMP rec
学位
[目 的]分析老年艾滋病(Acquired 2Immune Deficiency Syndrome,AIDS)患者在ART(Anti-Retroviral Therapy,ART)后发生非艾滋病定义性疾病(Non-AIDS defined diseases,NADS)的流行情况,探讨其相关影响因素,为临床随访评估、制定预防控制措施,减少老年HIV/AIDS进一步发生多器官功能障碍和严重并发症提供依
学位