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[目 的]研究分析基于不同抗病毒治疗方案治疗HIV/AIDS患者,48周后病毒载量≥1000copies/mL的患者其血项、肝功、肾功、免疫水平等多项指标,以及HIV-1病毒pol区基因变异的规律,为评估HIV抗病毒治疗疗效及用药后不良反应,指导临床医生优化治疗方案提供理论依据。[方 法]本研究选取2016年1月～2020年12月间在云南省传染病医院接受抗病毒治疗满一年的艾滋病感染者（HIV）/艾滋病（AIDS）患者,按照不同治疗方案分为 A 方案:AZT+3TC+EFV/NVP、B 方案:TDF+3TC+EFV/NVP、C 方案:AZT+3TC+LPV/r、D方案:TDF+3TC+LPV/r共四组,收集其血项、血脂血糖、肝肾功能及免疫学指标数据进行综合分析。同时通过RT-PCR方法扩增这些患者血浆HIV-1病毒pol区基因片段,进行基因分型,并采用SNAP、Entropy、VESPA等在线分析工具进一步分析基因变异特征。[结 果]1.共入组符合标准的HIV/AIDS患者共347例,其中男性占69.74%,年龄主要集中在20～40岁,占51.87%,民族以汉族居多,占85.30%,婚姻状况主要为未婚,占47.84%,文化程度主要为初中,占35.45%,传播途径主要为异性性传播,占40.06%。2.入组患者中使用A方案的共193人,B方案的共100人,C方案的共25人,D方案的共29人,不同治疗方案在性别、年龄、民族、婚姻状况、文化程度、传播途径及基线CD4+T淋巴细胞计数中均为一线方案使用人数多于二线方案,其中在基线CD4+T淋巴细胞计数＜50个/μl的患者中,使用一线TDF方案的人数多于一线AZT方案。3.血常规:A方案治疗后RBC均低于基线水平,随时间呈下降趋势,WBC治疗后4周、8周低于基线,随时间先降后升,HGB治疗后8周内呈下降趋势,PLT治疗后均高于基线;B方案治疗后12周、48周时WBC高于基线,HGB随时间呈上升趋势。4.血脂血糖:C方案治疗后4周时TG和Glu高于基线,D方案治疗后12周时TG高于基线,Glu治疗后48周高于基线;C方案的TC相较A方案平均升高了0.287mmol/L,D方案治疗后48周时TC高于基线,且随时间呈上升趋势。5.肝功能:A方案治疗后4周、24周和48周时ALT高于基线,治疗后24周时AST高于基线;而B方案治疗后4周时ALT高于基线;两组一线方案的T-Bil治疗后4周、8周低于基线,且相较A方案,B方案的T-Bil更低,平均降低了1.28μmol/L。6.肾功能:B方案治疗后48周时CREA高于基线;A、B方案治疗后4周、24周和48周时UREA均高于C、D方案;A方案和B方案分别在治疗后8周和12周时UA低于基线,且相较于A方案,B方案的UA更高,平均升高了 22.19μmol/L。7.免疫学:A、B、D方案在治疗后24周和48周的CD4+T淋巴细胞计数均高于基线水平,不同方案治疗后CD4+T淋巴细胞计数达正常的患者比例均有所增加,且增加趋势有统计学意义（χ2=5.853,P=0.016）,治疗后各方案间CD4+T淋巴细胞计数的正常率分布差异无统计学意义。8.在三种主要亚型中,一线方案的基因距离均大于二线方案,Ks/Ka值均小于二线方案,CRF01AE为基因距离最大,Ks/Ka值最小的亚型,且四种治疗方案下的HIV-1毒株所受选择压力均为负向选择压力。9.在一线治疗方案中,含AZT和含TDF方案作用下的HIV-1毒株相较标准株均形成了不同的特征性碱基组成模式,两种方案间的特征性碱基出现频率也各不相同,在CRF08BC中,TDF组中有4个位点,AZT组中有1个位点;在CRF01AE中,TDF组中有17个位点,AZT组中有15个位点;在CRF07BC中,TDF组中有1个位点,AZT组中有2个位点。10.在CRF08BC中,两组一线方案中共有40个位点的氨基酸多态性分布差异有统计学意义,其中AZT组多态性大于TDF组的共有26个位点;在CRF01AE中,共有67个位点的氨基酸多态性分布差异有统计学意义,其中AZT组多态性大于TDF组的共有50个位点;在CRF07BC中,共有42个位点的氨基酸多态性分布差异有统计学意义,其中AZT组多态性大于TDF组的共有13个位点。[结论]1.不同治疗方案,药物对HIV/AIDS患者各系统均产生了药物不良反应。其中使用一线AZT方案治疗患者的血液系统指标、使用二线方案治疗患者的血脂血糖、一线方案和二线方案治疗患者肝脏酶学指标、一线TDF方案治疗患者肾功能指标均呈现不同程度的变化,提示我们在临床治疗中针对服用不同组合药物的患者应警惕不同的药物不良反应以及时调整治疗方案,提高抗病毒治疗效果。2.不同治疗方案,患者的细胞免疫功能均得到一定程度的恢复,恢复程度存在一定差异,所有HIV/AIDS患者的CD4+T淋巴细胞计数呈现不同程度的增加,治疗后早期增长速度较快,后期增长速度变缓。3.不同治疗方案,HIV-1毒株变异程度不同,其中一线治疗方案由于应用时间较长,其病毒基因距离更大,Ks/Ka更小,变异程度更高。4.接受一线TDF治疗方案的患者保守性特征性碱基更多,而一线AZT方案的氨基酸多态性更丰富,随着治疗时间的延长,这些多态性的增加预警耐药突变出现的可能性更高,提示我们应该加强对使用AZT方案治疗的患者体内HIV-1毒株基因变异的监测。