基于细胞死亡基因的分子亚型预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗效果

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chenziling
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[目的]肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是世界上许多地区癌症相关死亡的主要原因之一。细胞死亡在肿瘤的发生发展中起着重要作用,目前还没有研究对细胞死亡基因在HCC中的作用进行全面的分析。本研究的目的是根据细胞死亡基因识别不同的HCC分子亚型,并比较不同亚型的预后和免疫治疗效果。[方法]使用单因素COX分析分别在癌症基因组图谱(The cancer Genome Atlas,TCGA)数据库、国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium,ICGC)数据库、基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中筛选出与HCC预后相关的细胞死亡基因。基于细胞死亡基因的表达,利用NMF共识聚类对HCC进行亚型分类。通过R软件中的多种算法,分析肿瘤微环境评分、溶细胞免疫评分、炎症评分、肿瘤突变负荷、免疫检查点表达水平、TIDE评分在不同亚型间的差异。[结果]通过COX分析,发现了 8个与预后相关的细胞死亡基因。基于这8个基因,通过NMF共识聚类分析识别出两个不同的HCC亚型。生存分析结果显示C1亚型的中位生存期明显长于C2亚型。临床特征差异性分析结果显示,C2亚型的肿瘤分期显著高于C1亚型。肿瘤微环境分析结果显示,C2亚型的免疫评分、免疫细胞浸润丰度高于C1亚型。溶细胞免疫评分及炎症评分结果显示,C2亚型高于C1亚型。免疫检查点分子表达量及TIDE评分结果显示,C2亚型高于C1亚型。[结论]基于8个与HCC预后相关的细胞死亡基因在三套数据集中的表达值,将HCC分为两个亚型(C1和C2)。与C2亚型相比,C1亚型预后及肿瘤组织学分级更佳,且根据TIDE评分预测C1亚型免疫治疗效果更佳。在临床诊疗中,更佳推荐C1亚型采用免疫治疗。
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