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1研究背景与目的食管鳞状细胞癌（Esophageal squamous cell carcinoma,ESCC）是中国食管癌的主要组织学亚型,约占中国人群所有食管癌病例的90%。食管鳞癌患者的预后极差,5年生存率仅在15%-25%左右。但很多中晚期食管鳞癌患者术后的预后很好,生存时间远超5年,甚至10年以上,对于术后生存时间在10年及以上的中晚期食管鳞癌患者我们称之为超长期生存（Ultra-long survival,ULS）患者,术后生存时间＜10年的中晚期食管鳞癌患者我们称之为非超长期生存（Non ultra-long survival,NULS）患者。本研究团队对超长期患者以及非超长期患者两组人群进行了全外显子测序（Whole Exome Sequencing,WES）,对比两组之间的基因突变特征,以期找到影响食管鳞癌患者超长期生存的基因突变特征。2材料与方法2.1研究对象本研究分析了151例接受根治性手术治疗、经手术后确诊为食管鳞癌患者的资料。将151例食管鳞癌患者分为超长期组和非超长期两组,超长期组共19例,非超长期组132例。2.2患者临床诊疗和病理信息收集和规范本研究所使用的临床诊疗以及病理信息主要根据患者的住院病历记录,由专家指导进行数据的录入,并按照相关标准进行规范整理2.3随访本研究主要通过电话、家访和村医与患者或患者家属直接联系等系统查询方式进行随访,每年进行一次随访,记录去世时间和主要死因等。2.4统计学分析统计学采用SPSS21.0进行数据分析。两组资料的组间分布比较采用卡方检验,采用Kaplan-Meier分析影响患者生存的因素,采用Cox回归模型分析影响患者生存状况的独立因素。2.5全外显子测序流程对样品进行质检,DNA质检合格后进行文库构建,文库构建完成后将样品进行上机检测,得到原始测序数据,对测序得到的原始数据进行质量评估。最后对检测结果进行分析,Somatic SNP使用Mu Tect软件分析;Somatic Insertion和Somatic Deletion使用Strelka软件分析;高频突变基因使用Mutsig CV软件分析;高频突变基因的通路富集分析使用Path Scan软件分析;代谢通路数据库为KEGG。3结果3.1超长期患者的临床病理特征及其对预后的影响超长期组中年龄＜60的患者约占68.4%,而非超长期组中年龄＜60的患者仅占34.1%（χ~2=8.275,P=0.004）。但年龄、性别、高/低发区、吸烟史、饮酒史、家族史、肿瘤部位、大体类型、分化程度、淋巴结转移、TNMstage均不是影响食管鳞癌超长期患者预后的因素。3.2非超长期患者的临床病理特征及其对预后的影响非超长期患者的Cox多因素分析结果显示年龄、家族史是非超长期患者预后的独立影响因素,年龄≥60岁患者的死亡风险是年龄＜60岁的1.732倍（P=0.006,HR=1.732,95%CI:1.172-2.56）。家族史阴性患者的死亡风险是家族史阳性患者的1.501倍（P＜0.05,HR=1.501,95%CI:1.034-2.179）。3.3食管鳞癌超长期与非超长期全外显子测序结果3.3.1食管鳞癌超长期与非超长期组基因突变情况在超长期组中共检测到4082个发生突变的基因,在非超长期组中共检测到11684个发生突变的基因,其中超长期组和非超长期组中均发生突变的基因有3119个,超长期组高频突变基因有TP53、ZNF737、NAV2、FHOD3、SRCAP等11个基因。3.3.2食管鳞癌超长期组和非超长期组基因突变谱对比分析在超长期组中的11个高频突变基因中,发现ZNF737（32%vs.6%）、NAV2（26%vs.4%）、MED12（21%vs.4%）、MYH9（21%vs.4%）共4个差异基因,4个差异基因均在超长期组突变频率较高,但在非超长期组突变频率较低,P＜0.05。3.3.3食管鳞癌超长期组和非超长期组差异基因对预后的影响3.3.3.1差异基因类型对预后的影响采用Kaplan-Meier生存分析结果显示NAV2、MYH9、ZNF737基因的突变型生存明显好于野生型,P＜0.05;MED12基因的突变型和野生型之间的生存无差异。3.3.3.2差异基因对食管鳞癌超长期和非超长期患者预后的影响MYH9等4个差异基因的突变均不是超长期患者预后的影响因素。NAV2基因突变是非超长期患者预后的独立影响因素,NAV2基因野生型的死亡风险是突变型的2.854倍（P＜0.05,HR=2.854,95%CI:1.034-7.88）,MYH9等3个差异基因的突变不是非超长期患者预后的独立影响因素。3.3.4食管鳞癌超长期组和非超长期组差异基因在临床表型中的分布ZNF737、MYH9基因在年龄＜60岁的患者中的突变频率明显高于年龄≥60岁患者中的突变频率。ZNF737基因在饮酒患者中的突变频率明显高于不饮酒患者,在肿瘤直径为0-4cm的患者中的突变频率为11.6%,但在肿瘤直径＞4cm的患者中并未发生突变（P＜0.05）。3.3.5 KEGG通路富集将超长期患者中的突变基因在KEGG数据库中进行通路富集,未富集到相关通路。将非超长期患者组中的突变基因在KEGG数据库中进行通路富集,富集到2条相关通路,分别为细胞因子-细胞因子受体相互作用通路（Cytokine-cytokine receptor interaction）、嗅觉转导信号通路（Olfactory transduction）。4结论1)超长期组中低年龄患者较多,但年龄不是超长期患者预后的影响因素,而是非超长期患者预后的独立影响因素。2)MED12、NAV2、MYH9、ZNF737在超长期组的突变频率明显高于非超长期组。3)NAV2、MYH9、ZNF737基因发生突变的患者生存好于未发生突变的患者。4)NAV2基因突变是非超长期患者预后的独立影响因素。