【摘 要】
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目的:利用TCGA数据库,通过生物信息学方法分析甲基转移酶样蛋白-5（METTL5）在肝细胞癌组织中的表达及临床特点。方法:基于TCGA数据库收录肝癌患者临床及METTL5 m RNA表达的数据。使用R（4.1.0）进行分析,Wilcoxon Test和配对T检验分析METTL5 m RNA在癌组织及癌旁组织表达的差异;Kaplan-Meier分析METTL5对肝癌患者预后的影响;K-S检验分析M
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目的:利用TCGA数据库,通过生物信息学方法分析甲基转移酶样蛋白-5（METTL5）在肝细胞癌组织中的表达及临床特点。方法:基于TCGA数据库收录肝癌患者临床及METTL5 m RNA表达的数据。使用R（4.1.0）进行分析,Wilcoxon Test和配对T检验分析METTL5 m RNA在癌组织及癌旁组织表达的差异;Kaplan-Meier分析METTL5对肝癌患者预后的影响;K-S检验分析METTL5在不同T分期、组织学分级、性别、年龄的表达差异;单因素及多因素COX分析评价影响肝癌患者预后因素。STRING和GEPIA2用于构建蛋白互作网络和筛选相似基因;GO,KEGG分析METTL5与相似基因的富集情况,应用GSEA进一步分析METTL5在肝癌中可能的功能,“p ROC包”进行诊断效能分析;TIMER数据库用于免疫浸润分析。结果:METTL5在肝细胞癌的组织表达显著高于癌旁组织（P=5.79e-26）、配对T检验同样显示METTL5 m RNA在癌组织中表达量明显高于癌旁组织（P=3.022e-15）。Kaplan-Meier曲线显示METTL5高表达的肝癌患者较低表达的患者预后差（P=0.019）。METTL5表达水平随T分期呈现上升趋势,T1和T2之间存在统计学差异（P=0.027）,其它分期之间无统计学差异。组织学分级:G3/4组的METTL5表达显著高于G1/2组（P=0.00042）。年龄方面:小于65岁的患者METTL5表达量明显高于年龄≥65岁的患者（P=0.0037）。性别之间无统计学差异。单因素及多因素COX分析得出T分期和METTL5表达水平与预后相关（P＜0.05）。GO和KEGG分析显示METTL5:在BP（生物学功能）中,富集于RNA剪接、m RNA剪接等;在CC（细胞组分）中,在剪接体复合体、U-2型剪接复合体等方面富集;在MF（分子功能）方面,富集于一碳单位转移酶活性、甲基转移酶活性、RNA甲基转移酶活性等;KEGG分析显示METTL5在剪接体起重要作用。GSEA富集分析显示:剪接体、嘧啶代谢途径、RNA降解途径、同源重组途径在METTL高表达时富集（NSE＞0）。PPAR信号通路、细胞色素P450相关药物代谢、补体途径、丁酸盐代谢、丙酸代谢、脂肪酸代谢、初级胆汁酸生物合成、视黄醇代谢、多种氨基酸的代谢与降解等在METTL5低表达时富集（NSE＜0）。诊断效能分析显示METTL5在区分肝癌组织和正常组织方面具有较高的诊断效能（AUC=0.959,CI=0.941-0.977）。METTL5与B细胞、CD8+T细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞6种免疫细胞均呈现正相关（partial.cor＞0）。其中,相关性最高的是巨噬细胞（P=2.41e-12）、其次是B细胞（P=2.54e-7）。此外,METTL5表达还与肿瘤纯度（purity）呈正相关（cor=0.173,P=1.25e-3）。结论:肝癌组织中METTL5表达高于癌旁组织且表达水平与T分期、组织学分级及年龄相关。METTL5高表达患者预后差,可作为独立预后指标。METTL5对于肝癌具有较好的诊断效能（ROC曲线下AUC0.959,CI=0.941-0.977）,且可能通过与剪接体的协同作用及抑制PPAR信号通路促进肝癌的发生发展,并参与免疫微环境的调节,有望成为今后靶向治疗的新靶点。
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