【摘 要】
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背景及目的结直肠癌是最常见的恶性肿瘤之一,根据国际癌症研究机构提供的数据,结直肠癌是第三常见的恶性肿瘤,死亡率位居癌症相关死亡的第二位。SPOCD1是最近发现的一个新基因,编码属于转录因子S-Ⅱ（TFⅡS）家族的一种蛋白质。研究表明,SPOCD1基因的表达与肿瘤增殖、侵袭和迁移活动密切相关。然而,SPOCD1基因在结直肠癌中的预后价值和潜在功能尚未被研究。本研究旨在通过生物信息学分析,探索SPOC
【基金项目】
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广东省自然科学基金（2018A030313537）；
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背景及目的结直肠癌是最常见的恶性肿瘤之一,根据国际癌症研究机构提供的数据,结直肠癌是第三常见的恶性肿瘤,死亡率位居癌症相关死亡的第二位。SPOCD1是最近发现的一个新基因,编码属于转录因子S-Ⅱ（TFⅡS）家族的一种蛋白质。研究表明,SPOCD1基因的表达与肿瘤增殖、侵袭和迁移活动密切相关。然而,SPOCD1基因在结直肠癌中的预后价值和潜在功能尚未被研究。本研究旨在通过生物信息学分析,探索SPOCD1基因在结直肠癌中的表达、临床相关性和预后价值,并进一步探究其作用机制。研究方法首先,我们从TCGA数据库、GTEx数据库和GEO数据库中获得结直肠癌的转录组数据,分析结直肠癌组织和正常组织之间SPOCD1基因的表达差异,并通过RT-qPCR技术验证了 SPOCD1基因在几种常见的结直肠癌细胞系中的表达量。然后我们从TCGA数据库中获取了结直肠癌患者的预后信息,分析了 SPOCD1基因表达量与结直肠癌患者的预后相关性。接着,我们通过cBioPortal网络平台分析SPOCD1基因在结直肠癌中的甲基化水平;使用MethSurv探究SPOCD1基因甲基化水平与结直肠癌患者的预后价值。最后,我们通过基因集富集分析（GO分析和GSEA分析）探索SPOCD1基因所参与的细胞成分、生物学功能、分子功能和信号通路,并通过TIMER 2.0平台分析SPOCD1基因表达与结直肠癌组织中免疫浸润的关系。研究结果与正常组织相比,SPOCD1基因在结直肠癌组织中高表达（p＜0.001）;而RT-qPCR结果也证明了 SPOCD1基因在常见的结直肠癌细胞系,特别是微卫星不稳定型结直肠癌细胞系中高表达（p＜0.05）。Kaplan-Meier生存分析显示,SPOCD1基因的高表达与结直肠癌的不良预后相关（HR=1.61,95%可信区间:1.14-2.28,p＜0.05）。SPOCD1基因的甲基化水平在直肠癌组织中较正常组织低（p＜0.05）,而SPOCD1基因低甲基化结直肠癌患者比高甲基化结直肠患者的总生存期更短（p＜0.05）。GSEA富集分析发现SPOCD1基因表达与尖端连接通路、上皮-基质转化（EMT）通路、验证反应通路、干扰素-γ通路和KRAS信号通路等相关。通过分析SPOCD1基因相关的免疫细胞浸润水平,SPOCD1基因表达量的改变与结直肠癌组织中多种类型的免疫细浸润水平变化相关,对结直肠癌组织的肿瘤微环境有着显著的影响。结论SPOCD1基因过度表达与结直肠癌的不良预后密切相关,SPOCD1基因有望成为结直肠癌新的生物学研究靶点、新的治疗靶点和潜在的预后生物标志物。
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